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          【中文期刊】 程呈  卢帅  等 《中华损伤与修复杂志(电子版)》 2025年20卷2期 99-106页ISTICCA

          【摘要】 目的探究在非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)发展过程中发生显著变化的炎症损伤相关核心基因。方法从基因表达数据库(GEO)的GSE167523 数据集中选择98 例NAFLD 患者,通过基因集变异分析(GSVA)计算炎症指数。 设置高炎症指数和...

          【关键词】 GEO 数据库非酒精性脂肪性肝病炎症损伤

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          【中文期刊】 谭玲芳  周克兵  《中华肺部疾病杂志(电子版)》 2023年16卷3期 329-334页ISTIC

          【摘要】 目的:为寻找支气管哮喘患者潜在的诊断生物标志物,基于生物信息学分析方法。方法:从基因表达芯片(GEO)数据库获得以哮喘患者和健康志愿者为试验对象的GSE41861和GSE64913支气管上皮细胞基因表达数据集。通过对高通量芯片数据进行提取,...

          【关键词】 支气管哮喘生物信息学差异基因

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          【中文期刊】 张敏洁  王雅晳  等 《中华临床医师杂志(电子版)》 2023年17卷4期 438-445页ISTICCA

          【摘要】 目的:基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学分析筛选与大鼠心肌缺血再灌注损伤(MIRI)相关的关键基因(Hub gene)、通路及候选药物。方法:从GEO数据库下载大鼠GSE122020数据集并利用GEO2R在线工具筛选差异表达基因(D...

          【关键词】 GEO数据库生物信息学心肌缺血再灌注损伤

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          【中文期刊】 华杨  孙劲禹  等 《中华心脏与心律电子杂志》 2023年11卷1期 32-38页

          【摘要】 目的:利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法筛选与肥厚型心肌病(HCM)发生相关的关键基因,为今后的研究提供线索。方法:首先,从公共基因表达数据库(GEO)下载GSE36961和GSE160997数据集,使用R语言中的“limma”和...

          【关键词】 肥厚型心肌病GEO数据库差异基因

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          【中文期刊】 于曼  余珉  等 《中华劳动卫生职业病杂志》 2021年39卷2期 91-98页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

          【摘要】 目的:分析恶性胸膜间皮瘤(MPM)基因突变概况和高频突变基因的表达水平,筛选出影响MPM患者预后的关键分子和临床病理因素。方法:于2020年3月,分别从癌症基因组图谱(TCGA)数据库和人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库下载86例MP...

          【关键词】 间皮瘤胸膜SETD2

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          【中文期刊】 王玉  杨雪  等 《中草药》 2020年51卷20期 5207-5219页ISTICPKUCSCDCA

          【摘要】 目的 采用GEO数据库、整合药理学平台v2.0和分子对接技术探讨大黄抗肝癌的活性成分及其分子机制.方法 利用中医药整合药理学平台(TCMIP)筛选中药大黄的活性成分,借助TCMIP及Swisstarget在线数据库预测作用靶点;从GEO数据...

          【关键词】 整合药理学平台GEO数据库分子对接

          OA
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          【中文期刊】 胡鑫  高悦  等 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2020年27卷8期 903-910页ISTICPKUCSCDCA

          【摘要】 目的:运用生物信息学方法结合基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选参与胃癌发生发展的关键基因,以获得用于胃癌诊断、治疗靶标选择及预后判断相关分子标志物.方法:从GEO数据库中下载与胃癌(gastric ...

          【关键词】 胃癌分子标志物GEO数据库

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          【中文期刊】 颜朝阳  徐同欣  等 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2020年27卷12期 1393-1398页ISTICPKUCSCDCA

          【摘要】 目的:通过TCGA和GEO数据库筛选与食管腺癌相关的关键基因,并分析其生物学功能、相关信号通路和临床意义.方法:综合TCGA数据库食管腺癌数据和GEO数据库GSE92396芯片数据,使用R软件的DEseq2包和Limma包进行差异表达基因分...

          【关键词】 食管腺癌TCGA数据库GEO数据库

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          【中文期刊】 贺利平  陈毅斐  等 《中华医学杂志》 2017年97卷38期 3022-3027页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

          【摘要】 目的 探讨前列腺素D2合成酶(PTGDS)在非小细胞肺癌(NSCLC)[包括肺腺癌(ADC)和肺鳞癌(SCC)]中的作用及可能的机制.方法 首先,通过基因表达汇编(GEO)数据库对PTGDS在ADC和SCC中各自的蛋白表达进行分析.然后,通...

          【关键词】 基因表达汇编(GEO)数据库前列腺素D2合成酶非小细胞肺癌

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          【中文期刊】 姜秋竹  杨会  等 《国际移植与血液净化杂志》 2021年19卷2期 8-12页

          【摘要】 目的:寻找肾脏纤维化发生的关键基因和潜在机制,为肾脏纤维化早期诊断和治疗提供评估手段和新思路。方法:在基因表达综合数据库(GEO数据库)中进行搜索找出信息芯片GSE102515,筛选出差异基因,找出下调基因和上调基因。通过DAVID数据库对...

          【关键词】 肾脏纤维化GEO数据库关键基因

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