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            【中文期刊】 陈文杰  肖钧  等 《生命科学研究》 2023年27卷5期 435-446页ISTICCA

            【摘要】 为筛选骨关节炎(osteoarthritis,OA)免疫浸润相关基因,从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中获取多个芯片数据,分为训练集以及验证集,筛选出差异表达基因(differentially ex...

            【关键词】 生物信息学骨关节炎(OA)基因集富集分析(GSEA)

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            【中文期刊】 黄艳青  黄金彪  等 《辽宁中医杂志》 2025年52卷12期 18-23,后插2-后插4页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 从血管新生的角度探究其在肝纤维化发生发展过程中潜在的分子机制,寻找具有临床和治疗意义的生物标志物.方法 通过基因综合表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)和GeneCards数据库分别检索肝纤维化相关数据...

            【关键词】 血管新生肝纤维化加权基因共表达网络分析

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            【中文期刊】 刘源  渠源  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷25期 5486-5500页ISTICPKUCA

            【摘要】 背景:基底膜基因与类风湿关节炎的发生发展密切相关,但不同中医证型下基底膜相关基因在其发病机制中的作用尚不明确.目的:基底膜基因联合转录组学分析探讨类风湿关节炎5种不同中医证型的发病机制差异,并进行潜在治疗药物预测.方法:基于GEO数据库整理...

            【关键词】 基底膜相关基因证型类风湿关节炎

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            【中文期刊】 王建平  霍子天  等 《生命科学研究》 2024年28卷2期 143-151页ISTICCA

            【摘要】 免疫细胞一直被认为是维持机体平衡的重要调节因子,对肿瘤浸润免疫细胞进行量化分析有望揭示免疫系统在肿瘤中的多方面作用.本文总结了量化肿瘤浸润免疫细胞的计算方法及相关的分析工具,包括基于标志基因富集分析方法和反卷积分析方法开发的算法模型与工具,...

            【关键词】 肿瘤肿瘤浸润免疫细胞(TIC)基因集富集分析(GSEA)

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            【中文期刊】 曾茂林  徐婷  等 《重庆医科大学学报》 2023年48卷2期 190-194页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:肝细胞癌预后相关的分子标志物对提高患者生存质量和改善疗效至关重要,本研究旨在探究细胞分裂周期相关基因8(cell division cycle associated 8,CDCA8)对肝细胞癌预后的影响及潜在分子机制.方法:432例肝...

            【关键词】 CDCA8肝细胞癌TCGA

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            【中文期刊】 吴德俊  徐安军  等 《复旦学报(医学版)》 2022年49卷5期 642-648,664页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 目的 研究半胱氨酸蛋白酶抑制因子Cystatin 6(CST6)在结肠癌中的表达及其与肿瘤血管生成的关系.方法 利用肿瘤基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)分析CST6在正常结肠上皮、无转移性结肠癌和...

            【关键词】 结肠癌CST6基因富集分析(GSEA)

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            【中文期刊】 王艳秋  周倩  等 《现代消化及介入诊疗》 2023年28卷1期 50-56页ISTIC

            【摘要】 目的 探究铜死亡相关基因在慢加急性肝衰竭(Acute-on-chronic liver failure,ACLF)发生发展中的作用,从而进一步研究ACLF与铜死亡相关的发病机制.方法 从GEO(Gene Expression Omnibus...

            【关键词】 慢加急性肝衰竭铜死亡差异表达基因

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            【中文期刊】 尹晓红  刘小平  等 《现代泌尿外科杂志》 2017年22卷11期 818-822页ISTICCA

            【摘要】 目的 探讨TAGLN基因在膀胱癌患者中的表达情况及与临床病理特征的关系,评价其对膀胱癌患者临床预后的影响.方法 检索并下载GEO膀胱癌基因表达数据集,分析膀胱癌患者基因表达谱数据及临床信息,明确TAGLN基因对膀胱癌患者预后的影响,并通过基...

            【关键词】 TAGLN基因膀胱癌临床预后

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            【中文期刊】 温琪  李昂  等 《实用预防医学》 2014年21卷1期 3-8页ISTICCA

            【摘要】 目的 以WTCCC工期公开发表的高血压SNPs数据作为实际数据,展开基于MAX的生物学通路分析,完成该方法的实现过程,并探讨其优势. 方法 运用Python语言和PLINK软件对数据进行格式转换,应用MAX方法进行单个SNP位点的关联分析,...

            【关键词】 单核苷酸多态性通路MAX方法

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            【中文期刊】 蒋振  谢杰斌  等 《中国细胞生物学学报》 2022年44卷10期 1885-1895页MEDLINEISTICCSCDCA

            【摘要】 脱氧尿苷三磷酸核苷酸水解酶(deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase,dUT-Pase)是由DUT基因编码的DNA合成过程中的关键酶.研究显示其在维护基因组稳定性过程中充当基因组管家的...

            【关键词】 dUTPaseGSEA增殖

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