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【中文期刊】 Hui Wan Liang Chen  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷5期 939-958页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Current cell-type annotation tools for single-cell RNA sequencing(scRNA-seq)data mainly utilize well-annotated source da...

【关键词】 Cell-type annotation； Transfer learning； Privacy preservation；

【中文期刊】 张极峰 白晓轩  等 《生物学杂志》 2024年41卷5期 20-25页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 为充分解析草酸青霉SG-4的遗传信息,利用二代Illumina测序和三代PacBio测序相结合的方法对SG-4的全基因组进行测序,经过基因组组装、基因预测和功能注释后,对全基因组进行共线性分析和次级代谢产物合成基因簇预测.结果表明,草酸青霉...

【关键词】 草酸青霉； SG-4； 基因组；

【中文期刊】 李梦鸽 张晨源  等 《山西医科大学学报》 2024年55卷6期 740-745页 ISTICCA

【摘要】 目的 筛选术后咽痛(postoperative sore throat,POST)病理过程中的差异表达的蛋白质,探讨POST的发生机制.方法 收集山西医科大学第一医院择期手术行全身麻醉气管插管患者的咽部分泌物20例,根据其术后24 h是否发...

【关键词】 术后咽痛； 蛋白质组学； Wnt信号通路；

【中文期刊】 卢丽颖 郑景辉  等 《西部中医药》 2024年37卷3期 60-66页 ISTIC

【摘要】 目的:探讨水蛭治疗心 肌梗死(myocardial infarction,MI)的差异靶基因和信号通路.方法:从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中检索与MI有关的数据芯片,利用GEO2R工具对数据...

【关键词】 心肌梗死； 水蛭； 差异基因；

【中文期刊】 阎思宇 谭杰骏  等 《医学新知》 2024年34卷11期 1276-1283页 ISTICCA

【摘要】 目的 探索搭建真实世界数据标注平台,并比较检索增强生成式技术(retrieval augmented generation,RAG)结合大语言模型,及预训练语言模型的预训练-微调方法的真实世界数据提取效果.方法 以真实世界电子病历数据中的膀...

【关键词】 真实世界数据； 电子病历； 标注平台；

【中文期刊】 张铭露 温苗  等 《药学前沿》 2024年28卷12期 663-670页 ISTICCA

【摘要】 目的 利用抗体芯片技术考察卵泡刺激素(FSH)在不同时间上对卵巢颗粒细胞(KGN)转化生长因子β(TGF-β)信号通路的影响.方法 FSH分别刺激KGN细胞3、6、12、24、48、72 h后收集细胞,进行不同时间点的蛋白磷酸化水平差异含量...

【关键词】 卵泡刺激素； 转化生长因子β信号通路； 人卵巢颗粒细胞；

【中文期刊】 白丽君 兰箐松  等 《中国食品学报》 2024年24卷10期 37-46页

【摘要】 为解析芽胞杆菌四甲基吡嗪(TTMP)生物合成途径,对筛选自高盐稀态酱醪的贝莱斯芽胞杆菌CS1.13全基因组进行注释,结合固态发酵研究其TTMP的生物合成途径及调控特征,结果显示:COG、GO及碳水化合物活性酶注释发现CS1.13参与氨基酸代...

【关键词】 贝莱斯芽胞杆菌； 四甲基吡嗪； 基因注释；

【中文期刊】 刘芳 舒志强  等 《食品科学》 2024年45卷22期 73-84页

【摘要】 为了详细解析从仿刺参肠道中分离出1 株具有较高酶活力高产褐藻胶裂解酶菌株S10的基因组序列信息,进而深入挖掘与褐藻胶裂解酶相关的基因资源,本研究通过形态学观察和16S rRNA序列分析对菌株S10进行菌种鉴定,然后利用Illumina二代测...

【关键词】 褐藻胶裂解酶； 溶藻弧菌； 全基因组测序；

【中文期刊】 马浩天 李杨  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷12期 5117-5127页

【摘要】 [目的]贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)CM7-4是从海水中分离的具有良好抗菌活性的芽孢杆菌.本试验旨在探究贝莱斯芽孢杆菌CM7-4的抗菌机理,并对其全基因组序列进行分析,以期挖掘其抗菌等功能特性基因.[方法]通过酸...

【关键词】 芽孢杆菌； 全基因组测序； 细菌素；

【中文期刊】 罗婷 韩著  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷5期 2154-2167页

【摘要】 旨在进一步完善牛支原体全基因组数据库,阐明其生物学功能和遗传进化关系,对西藏牦牛源牛支原体T10株进行了全基因组测序及其序列分析.使用Nanopore和Illumina PE150测序平台对T10株进行全基因组序列测定,利用生物信息学对其进...

【关键词】 牦牛； 牛支原体； 全基因组测序；