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【中文期刊】 韩昕 贺海燕  《中国医药生物技术》 2024年19卷3期 197-205页 ISTIC

【摘要】 目的 利用基因组挖掘策略在链霉菌中发现活性天然产物.方法 首先,全测序获得马来西亚链霉菌(Streptomyces malaysiensis DSM 41697)全基因组序列.利用 antiSMASH等在线工具对马来西亚链霉菌编码的潜在次级...

【关键词】 基因组挖掘； 帕达酰胺； 苯扎他汀；

【中文期刊】 雷茹 陶慧  等 《合成生物学》 2024年5卷3期 507-526页

【摘要】 萜类天然产物广泛分布于动物(包括海洋无脊椎动物)、植物、微生物中,具有复杂的化学结构和丰富的生物活性.人们通过从植物和微生物中直接分离提取的方式获得了大量萜类天然产物,然而随着越来越多化合物被发现,使用基于自然筛选的传统挖掘方式很难获得新的...

【关键词】 萜类天然产物； 萜类合酶； 微生物底盘；

【中文期刊】 宋永相 张秀凤  等 《合成生物学》 2024年5卷3期 474-491页

【摘要】 天然产物是医药与农药的重要来源.基因组测序和生物信息学分析技术的飞速发展,揭示了大量功能未知的天然产物生物合成基因簇,利用生物信息学工具,从这些庞大的基因簇数据中挖掘活性天然产物已经成为发现新型天然药物的重要途径.天然产物的生产者们利用自抗...

【关键词】 天然产物； 自抗性基因； 基因组挖掘；

【中文期刊】 奚萌宇 胡逸灵  等 《合成生物学》 2024年5卷3期 447-473页

【摘要】 天然产物是临床药物的主要来源,也是新药研发过程中先导化合物结构设计和优化的灵感源泉.但传统策略天然药源分子的发现却遭遇了瓶颈,新颖天然产物的数量逐渐无法满足现代药物开发的需求和应对全球多药耐药的威胁.随着测序技术的快速迭代,生物学的研究进入...

【关键词】 基因组挖掘； 天然产物； 药物发现；

【中文期刊】 李岩 冯健举  等 《生物资源》 2023年45卷4期 355-364页 ISTICCA

【摘要】 本论文以蜜环菌属(Armillaria mellea)真菌CPCC 400891为研究对象,基因组挖掘分析发现该菌株基因组中含有18个倍半萜合成酶编码基因,但其功能却鲜有报道.采用色氨酸营养缺陷型表达载体pYET,并以酿酒酵母(Saccha...

【关键词】 蜜环菌属； 基因组挖掘； 倍半萜合成酶；

【中文期刊】 张凡忠 相长君  等 《合成生物学》 2023年4卷4期 629-650页

【摘要】 自然界亿万年的进化孕育出了丰富的天然产物资源,进而为药物研发提供了巨大的分子宝库.进化导向生物信息学方法在微生物天然产物研究中发挥着越来越重要的作用.微生物基因组数据的快速增长为生物合成基因簇的大数据分析以及进化分析提供了新机遇,不仅让我们...

【关键词】 天然产物； 进化； 基因挖掘；

【中文期刊】 岳彩旭 贾楠  等 《聊城大学学报（自然科学版）》 2023年36卷4期 101-110页

【摘要】 Micrococcus luteus ML是从长期使用毒死蜱的农田土壤中分离出的一株能够降解毒死蜱及其高毒残留物 3,5,6-三氯-2-吡啶酚(TCP)的菌株.探究菌株 ML 降解机制,挖掘新型 TCP 代谢基因和特异代谢功能.采用Illu...

【关键词】 3,5,6-三氯-2-吡啶酚； 降解； 藤黄微球菌；

【中文期刊】 许慧敏 成颖  等 《食品研究与开发》 2023年44卷16期 40-47页

【摘要】 该研究针对一株海洋放线菌HM-01进行形态学及 16S rDNA分析,并对该菌株的发酵液提取物进行抑菌特性研究,采用antiSMASH对该菌株亲缘性较高的基因组序列进行次级代谢产物基因簇预测,并结合液相色谱-质谱分析,鉴定主要抑菌活性物质....

【关键词】 拟诺卡氏菌属； 海洋放线菌； 抑菌谱；

【中文期刊】 王珊珊 郭文强  等 《中国抗生素杂志》 2018年43卷1期 28-34页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 目的 在基因组信息指导下,研究茂源链霉菌Streptomyces mobaraensis US-43的代谢产物.方法 采用16S rRNA基因序列分析对菌株US-43进行初步分类鉴定,应用antiSMASH分析菌株US-43的基因组序列并预...

【关键词】 茂源链霉菌； 基因组挖掘； 杀粉蝶菌素A1；

【中文期刊】 王希玮 刘超兰  等 《中国抗生素杂志》 2018年43卷4期 424-428页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 目的 对湖泊放线菌SIIA-A16124进行分类鉴定和基因组挖掘.方法 采用多相分类法对菌株的形态学、生理生化、细胞壁化学组分、16S rRNA基因序列进行测定和分类鉴定,采用基因组挖掘分析生物合成基因簇,经发酵培养、抗菌活性检测及活性产物...

【关键词】 湖泊放线菌； 动孢菌SIIA-A16124； 分类鉴定；