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【中文期刊】 阳文攀 刘相杰  等 《畜牧兽医学报》 2025年56卷1期 213-221页

【摘要】 旨在比较不同基因组预测模型预测准确性与运行效率,以探究支持向量机(SVM)回归与随机森林(RandomForest)回归在基因组预测中的应用价值与应用前景.本研究使用博瑞迪猪50K液相芯片,采用GBLUP、BayesB、BayesLASSO...

【关键词】 长白猪； 繁殖性状； 基因芯片；

【中文期刊】 胡玉龙 杨芳  等 《遗传》 2024年46卷7期 560-569页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 基因组预测已成为畜禽、作物遗传评估和人类疾病风险预测的主要技术,但经典的基因组预测方法在性状遗传调控机制等生物学先验信息的整合方面有一定的不足.本研究提出一种将mRNA转录本信息整合应用于复杂性状表型预测的方法.基于国际上广泛应用于数量遗传...

【关键词】 基因组选择； 基因组预测； mRNA转录本；

【中文期刊】 钟欣 张晖  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷2期 438-450页

【摘要】 我国是世界上最大的生猪生产国和猪肉消费国,但仍存在着母系猪繁殖力普遍较低的重要问题,选育具有高繁殖性状的母系猪已成为当前研究的焦点和热点.目前,已明确多个影响母猪产仔数的已知基因,包括雌激素受体(estrogen receptors,ESR...

【关键词】 母猪繁殖力； 遗传育种基因； 全基因组关联分析；

【中文期刊】 吴华煊 杜志强  《畜牧兽医学报》 2024年55卷6期 2431-2440页

【摘要】 旨在探索并评估6种不同的单核苷多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)基因型特征提取方法.本研究分析比较了 6种方法:主成分分析(principal component analysis,PCA)、基...

【关键词】 基因组选择； 特征提取； 预测准确性；

【中文期刊】 李竟 张元旭  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷6期 2281-2292页

【摘要】 机器学习方法是全基因组选择研究的重要分支,深度学习是近年来机器学习领域新的研究热点.本文介绍了机器学习以及深度学习全基因组选择研究的原理和应用发展,分别从模型框架、模型参数、特征选择等方面对深度学习全基因组育种值估计研究进展进行了阐述,探讨...

【关键词】 全基因组选择； 研究进展； 机器学习；

【中文期刊】 王进部 李佳  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷7期 2775-2785页

【摘要】 基因组选择的广泛应用大大加快了畜禽的遗传进展.随着畜禽芯片的商业化和测序成本的不断降低,可获得的畜禽基因组信息越来越丰富.基因型标记数量远远超过具有表型数据的样本个数,基因组信息之间的关系更加复杂等问题也随之出现,使得最佳线性无偏预测(be...

【关键词】 基因组选择； 畜禽； 机器学习；

【中文期刊】 Boris Lukic Ino Curik  等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2024年15卷2期 546-562页

【摘要】 Background The importance of sheep breeding in the Mediterranean part of the eastern Adriatic has a long tradi-tion sinc...

【关键词】 Composite-likelihood ratio； East Adriatic sheep； Extreme ROH islands；

【中文期刊】 孙东晓 张胜利  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷10期 4028-4039页

【摘要】 基因组选择(GS)的基本原理是基于全基因组高密度标记(主要是SNPs)来评估和选择基因优良的个体.利用该技术,可以实现不依赖表型信息对青年公牛及后备母牛进行早期准确选择,将奶牛育种周期由5～6年缩短至2年左右,大幅度缩短世代间隔,从而显著降...

【关键词】 奶牛； 中国荷斯坦牛； 基因组选择；

【中文期刊】 李棉燕 王立贤  等 《中国农业科学》 2023年56卷18期 3682-3692页

【摘要】 基因组选择是指利用覆盖在全基因组范围内的分子标记信息来估计个体育种值.利用基因组信息能够避免因系谱错误带来的诸多问题,提高选择准确性并缩短育种世代间隔.根据统计模型的不同,基因组选择方法可大致分为基于BLUP(best linear unb...

【关键词】 机器学习； 深度学习； 基因组选择；

【中文期刊】 马浩然 张路培  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷10期 4174-4185页

【摘要】 旨在在系统对比分析亲缘关系不同计算方法基础上探索适合我国肉牛地方品种的亲缘关系评估方法.本研究主要以柴达木牛等10个肉牛地方品种为研究对象,使用重抽样方法获得地方品种的模拟数据,以此为基础使用PCA聚类结果为参照,分别利用预测误差方差、广义...

【关键词】 多品种基因组选择； 亲缘关系； 肉牛地方品种；