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【中文期刊】 Zhiting Wei Sheng Zhu 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2022年20卷5期 1028-1036页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Transcriptional phenotypic drug discovery has achieved great success,and various com-pound perturbation-based data resou...
【关键词】 Metric learning; Transcriptional profile similarity; Drug annotation;
【中文期刊】 刘祯 杨晓曦 等 《军事医学》 2019年43卷4期 252-259页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 利用基于网络的细胞反应印记整合文库(LINCS)计划的小分子化合物刺激不同细胞系的转录谱数据,构建算法评估化合物的抗辐射损伤活性,发现抗辐射损伤先导化合物.方法 基于基因本体(gene ontology,GO)数据库构建辐射防护基因集...
【中文期刊】 宋欣雨 文昱琦 等 《军事医学》 2018年42卷6期 424-428页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 利用基于网络的细胞反应印记整合图书馆(LINCS)计划药物扰动各细胞系的转录反应表达谱,构建基因共表达网络,探究药物的作用机制.方法 经过一系列数据预处理步骤,构建583种已上市药物扰动的转录反应表达谱数据集.计算每个药物刺激不同细胞...
【中文期刊】 刘祯 洪浩 等 《军事医学》 2018年42卷9期 694-700页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 利用基于网络的细胞反应印记整合文库(LINCS)计划的小分子化合物扰动不同细胞系的转录谱数据,结合辐射损伤的转录谱特征,寻找具有抗辐射损伤潜能的化合物,并推荐它们在特定细胞系上的实验剂量.方法 经过一系列数据处理步骤,构建了30722...
【中文期刊】 尚津锋 李倩楠 等 《中草药》 2022年53卷13期 4053-4064页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于蛋白质组学和LINCS数据库探讨预测中药复方不良反应的方法.方法 以黄连解毒汤为例,对黄连解毒汤干预脑缺血大鼠模型进行蛋白质组学分析,运用LINCS数据库、Python、RStudio等筛选与黄连解毒汤成分化合物结构相似和基因表达...
【外文期刊】 She, Weiwei ; Sun, Tianshou ; 等 《American journal of rhinology & allergy》 2023年37卷3期 313-323页
【外文期刊】 Chen, Yangzong ; Bao, Chunchun ; 等 《Cancer biology & therapy》 2019年20卷7/9期 1249-1257页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Thyroid carcinoma; radiosensitivity; LINC00511;
【外文期刊】 Zhang, Yifan ; Shao, Guojian ; 等 2022年52卷3期 367-373页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Matrix metallopeptidase 7; diabetic kidney disease; LINC01510;
【外文期刊】 Bo-Ya Zhang ; Zhe Jin ; 等 《Biomedicine & pharmacotherapy =: Biomedecine & pharmacotherapie》 2017年94卷 238-243页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Vascular endothelial cells; lncRNA; LINC00305;
【外文期刊】 Li, Yichun ; Li, Yannan ; 等 《Biomedicine & pharmacotherapy =: Biomedecine & pharmacotherapie》 2018年105卷 683-689页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 lncRNA; Linc-POU3F3; POU3F3;