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                【中文期刊】 任建芳  罗毅冲  等 《医用生物力学》 2024年39卷1期 46-54页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

                【摘要】 目的 探究力对FLNa-Ig21/αⅡbβ3-CT稳定性的影响及调控机制.方法 FLNa-Ig21/αⅡbβ3-CT晶体结构取自PDB数据库.通过平衡和拉伸分子动力学模拟,分析复合物生理环境下稳定性以及力诱导的解折叠路径和力学稳定性.结果 ...

                【关键词】 血小板整合素分子动力学模拟解折叠路径

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                【中文期刊】 Yating LU  Yu WANG  等 《浙江大学学报(英文版)(B辑:生物医学和生物技术)》 2021年22卷7期 575-589页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

                【摘要】 The aim of this work is to discover the inhibitory mechanism of tea peptides and to analyse the affinities between the p...

                【关键词】 Black teaAngiotensin-1-converting enzyme (ACE) inhibitory peptideKinetic study

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                【中文期刊】 张小轶  何红秋  等 《生物化学与生物物理进展》 2009年36卷5期 592-600页SCIISTICPKUCSCDCABP

                【摘要】 二酮酸类化合物(DKAs)是目前最有前景的HIV-1整合酶(integrase,IN)抑制剂.为了解DKAs引起的多种耐药株共有的耐药性机理,选择3种S-1360引起的IN耐药突变体,用分子对接和分子动力学模拟,研究了野生型和突变型IN与S...

                【关键词】 耐药性HIV-1整合酶分子动力学

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                【中文期刊】 潘露云  郑建仙  《中国食品添加剂》 2013年3期 229-232页ISTICCA

                【摘要】 采用分子动力学模拟方法,对人工甜味受体C60 (OH)20与3种单糖(葡萄糖、果糖、半乳糖)、3种双糖(蔗糖、麦芽糖、乳糖)及甜味抑制剂Na-PMP的相互作用过程分别进行了研究.结果表明:甜味剂的甜度与其和C60(OH)20的结合能有关,在...

                【关键词】 MD模拟富勒醇甜味剂

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                【中文期刊】 赵媛  曹泽星  《物理化学学报》 2017年33卷4期 691-708页

                【摘要】 酶催化包括底物到活性区的输运、选择催化化学反应及产物释放等复杂过程,由于复杂的蛋白质环境效应,任一化学和非化学过程都有可能是决定酶活性的关键步骤.为了全面认识酶催化活性,我们对几类酶催化过程进行了广泛的组合量子/分子力学(QM/MM)和经典...

                【关键词】 酶催化底物输运自由能计算

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                【中文期刊】 任家毅  杨志伟  等 《高等学校化学学报》 2017年38卷11期 2070-2076页

                【摘要】 以表皮生长因子Ⅲ型突变体(EGFRvⅢ)抗原多肽与其抗体(MR1)及其人源化突变体的复合物结构为出发点,采用分子动力学中的6种常用力场及3种常用溶剂水模型,分别对上述抗原-抗体复合物进行100 ns的分子动力学模拟与分子力学和连续介质模型计...

                【关键词】 单链抗体分子动力学模拟分子力学和连续介质模型的自由能计算

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                【中文期刊】 李涛  刘亚芳  等 《河南大学学报(自然科学版)》 2014年44卷5期 536-541页

                【摘要】 蛋白质可以影响晶体的成核及生长速率,从而改变晶体的形貌和习性,因此了解牙釉蛋白在羟基磷灰石(HAP)表面的相互作用对于了解牙齿的生长机理具有重要意义.采用分子动力学(MD)和操控式分子动力学(SMD)相结合的方法研究了六个不同取向的富亮氨酸...

                【关键词】 富亮氨酸牙釉蛋白(LRAP)羟基磷灰石(HAP)吸附

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                【中文期刊】 张继伟  卞富永  等 《物理化学学报》 2014年1期 183-193页

                【摘要】 多巴胺作为脑组织内一种重要的神经递质在细胞膜内外需要做合适的迁移,发挥其功能。多巴胺在细胞膜中扩散和透过过程的分子动力学涉及到多巴胺分子保护通道的畅通,与精神分裂症等病症有关。本文采用1-棕榈酰-2-油酰-卵磷脂(POPC)双层膜模拟细胞膜...

                【关键词】 多巴胺POPC细胞膜

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                【中文期刊】 《中国科学B辑(英文版)》 2007年50卷5期 665-674页

                【摘要】 Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) integrase (IN) is an essential enzyme in the lifecycle of this virus and als...

                【关键词】 molecular dockingMD simulationHIV-1 IN

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                【中文期刊】 Lu-nan Lv  Shi-jia Zu  等 《中国药理学报(英文版)》 2025年46卷12期 3376-3385页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

                【摘要】 Hyperuricemia and gout are increasingly prevalent among global health concerns,necessitating the development of more eff...

                【关键词】 GoutArthrobacter globiformis uricaserational mutant design

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