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【中文期刊】 Yating LU Yu WANG  等 《浙江大学学报（英文版）（B辑：生物医学和生物技术）》 2021年22卷7期 575-589页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 The aim of this work is to discover the inhibitory mechanism of tea peptides and to analyse the affinities between the p...

【关键词】 Black tea； Angiotensin-1-converting enzyme (ACE) inhibitory peptide； Kinetic study；

【中文期刊】 张小轶 何红秋  等 《生物化学与生物物理进展》 2009年36卷5期 592-600页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 二酮酸类化合物(DKAs)是目前最有前景的HIV-1整合酶(integrase,IN)抑制剂.为了解DKAs引起的多种耐药株共有的耐药性机理,选择3种S-1360引起的IN耐药突变体,用分子对接和分子动力学模拟,研究了野生型和突变型IN与S...

【关键词】 耐药性； HIV-1整合酶； 分子动力学；

【中文期刊】 任家毅 杨志伟  等 《高等学校化学学报》 2017年38卷11期 2070-2076页

【摘要】 以表皮生长因子Ⅲ型突变体(EGFRvⅢ)抗原多肽与其抗体(MR1)及其人源化突变体的复合物结构为出发点,采用分子动力学中的6种常用力场及3种常用溶剂水模型,分别对上述抗原-抗体复合物进行100 ns的分子动力学模拟与分子力学和连续介质模型计...

【关键词】 单链抗体； 分子动力学模拟； 分子力学和连续介质模型的自由能计算；

【中文期刊】 李涛 刘亚芳  等 《河南大学学报（自然科学版）》 2014年44卷5期 536-541页

【摘要】 蛋白质可以影响晶体的成核及生长速率,从而改变晶体的形貌和习性,因此了解牙釉蛋白在羟基磷灰石(HAP)表面的相互作用对于了解牙齿的生长机理具有重要意义.采用分子动力学(MD)和操控式分子动力学(SMD)相结合的方法研究了六个不同取向的富亮氨酸...

【关键词】 富亮氨酸牙釉蛋白(LRAP)； 羟基磷灰石(HAP)； 吸附；

【中文期刊】 《中国科学B辑（英文版）》 2007年50卷5期 665-674页

【摘要】 Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) integrase (IN) is an essential enzyme in the lifecycle of this virus and als...

【关键词】 molecular docking； MD simulation； HIV-1 IN；

【中文期刊】 李高峰 扈国栋  等 《生物化学与生物物理进展》 2017年44卷9期 783-791页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【关键词】 HIV-1蛋白酶； 抑制剂； 分子动力学模拟；

【中文期刊】 Ting CHEN Fan TONG  等 《浙江大学学报（英文版）（B辑：生物医学和生物技术）》 2020年21卷11期 885-896,中插7-中插11页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 目的:鉴定并阐述6个ACADVL新发突变的对细胞和分子功能的影响,为后期分子诊断和临床病例管理提供科学依据.创新点:本文从分子功能和结构的角度阐述6个新位点对蛋白和细胞功能的不同影响.方法:通过体外构建突变载体建立各突变的过表达细胞系,检测...

【关键词】 线粒体功能障碍； 极长链酰基辅酶A脱氢酶缺乏症； β氧化；

【会议论文】 第十七届国际生物物理大会;第十二届中国生物物理大会 2011年

【摘要】 Based on known mutation data on peptide-CDK2 interaction,it was found that Y180A,K178A(loss 100%and 50%binding between T...

【关键词】 CDK2； protein-peptide interaction； AutoDock；

【会议论文】 第十七届国际生物物理大会;第十二届中国生物物理大会 2011年

【摘要】 The tertiary structures of many riboswitch aptamers have been measured recently due to their importance in the transcrip...

【关键词】 preQ1 riboswitch； free state； MD simulation；

【外文期刊】 Ma, Yang-Chun ; Yang, Bing ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2020年38卷15/16期 4432-4448页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 PTP delta; SPB; virtual screen;