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【中文期刊】 Yinglong Miao Michael S.Wolfe 《中国神经再生研究(英文版)》 2025年20卷1期 174-180页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 γ-Secretase,called"the proteasome of the membrane,"is a membrane-embedded protease complex that cleaves 150+peptide subs...
【关键词】 Alzheimer's disease; amyloid precursor protein; cryo-EM structures;
【中文期刊】 罗旭东 李昕蓉 等 《中药新药与临床药理》 2024年35卷3期 376-383页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于UPLC-MS/MS、网络药理学方法预测红芪免疫调节的核心靶点及作用通路,通过分子对接、分子动力学技术对网络药理学结果进行验证,探讨红芪入血成分免疫调节的作用机制.方法 基于UPLC-MS/MS技术定性定量红芪入血成分;通过TCM...
【中文期刊】 张春艳 曹晓璐 等 《华中科技大学学报(医学版)》 2024年53卷1期 26-32页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于分子对接和动态模拟,联合整体动物水平研究,揭示葛根素缓解心肌缺血再灌注损伤的具体作用机制.方法 采用分子对接联合分子动态模拟技术预测葛根素与细胞沉默调节蛋白1(SIRT1)的结合潜力;结扎SD大鼠左冠状动脉前降支构建心肌缺血再灌注...
【中文期刊】 石玉珍 方颖 等 《医用生物力学》 2024年39卷6期 1197-1203页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究张力调控ICAP1/β1 整合素相互作用的机制与分子结构基础.方法 基于ICAP1/β1 整合素胞质尾部复合物的晶体结构数据(PDB ID:4DX9),通过拉伸分子动力学模拟,观察分析β1 整合素上的张力加载对ICAP1/β1 整...
【关键词】 β1整合素; 整合素细胞质结构域相关蛋白-1; 分子动力学模拟;
【中文期刊】 邓礼娟 黄洁瑶 等 《中国药理学通报》 2024年40卷12期 2269-2276页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 基于转录组学探究小檗碱(berberine,BBR)对糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)小鼠的改善作用及其潜在机制.方法 8周龄db/db小鼠随机分为模型组(DN组)、BBR 50 mg.kg-1 组(BBR...
【中文期刊】 赵东升 程铖 等 《中南药学》 2024年22卷1期 111-115页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于片段生长技术开发小分子PD-L1抑制剂.方法 根据已知的苯甲酰苯胺活性片段结构,使用FDA碎片库进行片段生长,然后使用分子对接和分子动力学对其进行进一步筛选,最终通过体外实验获得活性化合物.结果 获得一系列包含苯甲酰苯胺片段的分子...
【关键词】 药物设计; PD-1/PD-L1; 小分子抑制剂;
【中文期刊】 王昭志 贺宏吉 等 《生物信息学》 2024年22卷3期 204-216页 ISTIC
【摘要】 以PI3Kα作为靶蛋白,采用计算机辅助设计的方法优化去氢骆驼蓬碱结构,获得与靶蛋白结合力较高的化合物.在此基础上,利用分子对接,三维定量构效关系(3D-QSAR)和分子动力学技术验证了修饰化合物与靶蛋白的结合能力和稳定性.最后筛选出与靶标具...
【中文期刊】 刘一卜 汤磊 等 《山东医药》 2024年64卷3期 44-50页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于增强采样构建的隐式马尔可夫状态模型,分析胰高血糖素样肽1受体(GLP-1R)激动剂PF-06882961激活GLP-1R的机制.方法 从PDB数据库中下载GLP-1R晶体结构(PDBID:6X1A),基于该晶体结构构建PF0688...
【关键词】 胰高血糖素样肽1受体激动剂; PF-06882961; 胰高血糖素样肽1受体;
【中文期刊】 Jinru WENG Shuo YANG 等 《浙江大学学报(英文版)(B辑:生物医学和生物技术)》 2023年24卷10期 883-895,中插1-中插6页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 This study aims to gain insight into the DNA-specific recognition mechanism of c-Myb transcription factor during the reg...
【关键词】 c-Myb; DNA-specific recognition mechanism; Molecular dynamics simulation;
【中文期刊】 郭妍 郭怡琳 等 《食品工业科技》 2024年45卷2期 40-47页
【摘要】 为研究黄芩素阻断程序性细胞死亡-1/程序性细胞死亡配体 1(PD-1/PD-L1)通路的分子机制,本文首先采用分子对接、分子动力学模拟、结合自由能计算和主成分分析等方法预测了黄芩素的抑制作用,然后利用酶联免疫吸附试验(ELISA)进行了实验...
【关键词】 程序性细胞死亡-1/程序性细胞死亡配体1; 天然小分子; 黄芩素;