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          【中文期刊】 俞伟  宁璐璐  等 《食品与生物技术学报》 2017年36卷10期 1101-1105页

          【摘要】 通过生物大分子计算平台对分子动力学的模拟运算,计算值可以描述分子的运动轨迹,从而揭示原子间的内在关系,但这一过程较为复杂且昂贵.作者研究了较低投入下大分子计算平台的构建与优化,在并行GPU条件和CUDA体系下使用AMBER软件包完成分子动力...

          【关键词】 生物大分子分子动力学计算加速

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          【中文期刊】 蔡幸初  李兆达  等 《生命科学》 2025年37卷7期 894-903页ISTICCSCD

          【摘要】 蛋白质结构解析是理解生命机制与药物研发的核心.本文系统回顾了人工智能(artificial intelligence,AI)驱动下的蛋白质结构预测的进展、分子动力学(molecular dynamics,MD)模拟在揭示动态构象与分子互作中...

          【关键词】 蛋白质结构预测分子动力学模拟人工智能

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          【中文期刊】 刘婷婷  于坤千  《科研信息化技术与应用》 2015年4期 60-70页

          【摘要】 计算机药物设计是高性能计算应用的一个重要领域.本文针对药物设计领域,简要介绍了高性能计算技术在蛋白质分子动力学模拟、药物虚拟筛选、药靶反向对接、个性化药物设计中的应用.

          【关键词】 高性能计算计算机药物设计分子动力学模拟

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          【中文期刊】 李晓燕  李建志  等 《中国医药导报》 2018年15卷16期 146-149页ISTICCA

          【摘要】 基于分子对接的虚拟筛选方法已成为计算机辅助药物研究领域的一项重要技术,在揭示药物与机体标靶的作用机制以及药品研发过程中发挥着非常大的作用.使用传统的分子对接方法进行虚拟药物筛选,其操作流程复杂,无法实现自动对接以及计算结果自动收集.本文介绍...

          【关键词】 协同计算虚拟药物筛选脚本控制

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          【中文期刊】 雷红星  段勇  《生物物理学报》 2011年27卷3期 185,187-194页MEDLINEISTICCA

          【摘要】 蛋白质折叠是现代科学最具挑战性的难题之一.Anfinsen的先驱性工作已经过去数十年了,我们对蛋白质折叠的机理仍不甚了然.但值得庆幸的是,科学工作者们在解析几个模型蛋白质的折叠机理上已经取得了明显的进展.这篇综述将主要回顾在蛋白质折叠的计算...

          【关键词】 蛋白质折叠分子动力学折叠路径

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