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【中文期刊】 王丽君 王东梅 等 《北京医学》 2023年45卷6期 544-547页 ISTICCA
【摘要】 目的 调查中国北方汉族人群HLA-DQA1、-DQB1、HLA-DPA1、-DPB1 等位基因多态性.方法 选取2016年中华骨髓库造血干细胞志愿者1004人的外周血样,采用第2代测序方法(next generation sequence,...
【中文期刊】 张咪 张文新 等 《分子诊断与治疗杂志》 2024年16卷11期 2112-2115页 ISTIC
【摘要】 目的 制备同源重组修复缺陷检测(HRD)国家参考品,并建立其标准集,用于HRD体外诊断试剂产品的性能评价.方法 采用肿瘤组织永生化的细胞和配对白细胞永生化的细胞,制备不同DNA比例(50%,40%,30%,20%,10%)的HRD国家参考品...
【关键词】 同源重组修复缺陷; 聚腺苷二磷酸核糖聚合酶抑制剂; 生物标志物;
【中文期刊】 胡爽 陈长波 《计算机应用研究》 2024年41卷12期 3777-3785页
【摘要】 序列比对是基因组数据分析的关键一环,提高其比对效率对推动测序技术在医学、古生物学等领域的应用具有重要意义.针对BWA算法两大步骤之一的SAMSE存在冗余读取索引导致效率欠佳的问题,提出了新的算法BWA*.其通过运用流程优化消除了 SAMSE...
【中文期刊】 沈泽 田洋洋 等 《器官移植》 2023年14卷4期 570-577页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨肾移植受者耶氏肺孢子菌肺炎(PJP)的临床及流行病学特征.方法 收集2021年7月至2021年12月68例肾移植受者的临床资料,根据肺部感染情况分为PJP组(11例)、普通肺部感染组(24例)、非肺炎组(33 例).分析肾移植术后...
【中文期刊】 钟显信 巫望达 等 《中国实验血液学杂志》 2023年31卷1期 203-208页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:确认PCR-序列特异性寡核苷酸探针(SSOP)法检出的4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常和3例模棱两可结果样本的HLA真实基因型.方法:对HLA高分辨组织配型血样采用PCR-SSOP法检出的4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常和...
【关键词】 HLA; 等位基因; PCR-序列特异性寡核苷酸探针;
【中文期刊】 徐如意 曾丽云 等 《中国现代医生》 2023年61卷21期 9-14页
【摘要】 目的 总结并分析支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)检出低序列耶氏肺孢子菌(Pneu...
【中文期刊】 《中华医学杂志(英文版)》 2016年129卷9期 1009-1010页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The last Monday in February is the "Rare Disease Day" every year.This year the theme of it is "Join us in making the voi...
【关键词】 Rare Diseases; Next Generation Sequencing; Sequence Variants;
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2016年14卷4期 200-206页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Next-generation sequencing (NGS) is getting routinely used in the diagnosis of hereditary diseases, such as human cardio...
【关键词】 Next-generation sequencing; Quality control; Library preparation;
【中文期刊】 汪皓秋 俞骅 等 《中华预防医学杂志》 2018年52卷6期 647-652页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析一起食源性疾病事件中病原的基因组学特征.方法 选取事件中死亡病例血样和洗胃前胃内容物,以及其就餐食物作为样品,共11份,对金黄色葡萄球菌和蜡样芽胞杆菌以及有毒物质进行检测,并对食物中检测到的细菌进行计数.采用实时荧光PCR方法检测...
【中文期刊】 汪皓秋 俞骅 等 《中华微生物学和免疫学杂志》 2018年38卷2期 116-123页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 了解近年来杭州地区甲型副伤寒沙门菌的基因组流行病学特征.方法 采用二代测序技术(NGS)对2002—2013年杭州地区分离的60株甲型副伤寒沙门菌代表株进行测序并下载公共数据库中的391株甲型副伤寒沙门菌基因组数据.以ATCC9150...