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【中文期刊】 Lance M.O'Connor Blake A.O'Connor 等 《药物分析学报(英文版)》 2023年13卷8期 836-850页 SCIMEDLINECSCDCA
【摘要】 Bioinformatic analysis of large and complex omics datasets has become increasingly useful in modern day biology by provi...
【关键词】 Multi-omics integration; Systems bioinformatics; Data mining;
【中文期刊】 Shao-Wu Zhang Jing-Yu Xu 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2022年20卷5期 928-938页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Identification of cancer driver genes plays an important role in precision oncology research,which is helpful to underst...
【关键词】 Driver gene; Directed graph convolutional network; Multilayer perceptron;
【中文期刊】 Yongbing Zhao Jinfeng Shao 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2022年20卷5期 899-911页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Explainable artificial intelligence aims to interpret how machine learning models make decisions,and many model explaine...
【关键词】 Machine learning; Model interpretability; Gene expression;
【中文期刊】 Kelin Wang Muhammad Ali Abid 等 《分子植物(英文版)》 2023年1期 279-293页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Genomic prediction is an effective way to accelerate the rate of agronomic trait improvement in plants.Traditional metho...
【中文期刊】 Xiaomeng Xue Feng Li 等 《定量生物学(英文版)》 2024年12卷2期 173-181页
【摘要】 The identification of tumor driver genes facilitates accurate cancer diagnosis and treatment,playing a key role in preci...
【关键词】 cancer driver genes; feature extraction; multi-omics data;
【中文期刊】 Yuanpeng Xiong Xuan He 等 《定量生物学(英文版)》 2023年11卷3期 275-286页
【摘要】 Background:Chromatin-associated RNA(caRNA)acts as a ubiquitous epigenetic layer in eukaryotes,and has been reported to b...
【关键词】 deep learning; multi-omics data; RNA-chromatin;
【中文期刊】 Qian Zhang Mingran Yang 等 《癌症生物学与医学(英文版)》 2024年21卷4期 312-330页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Gastric cancer(GC),the fifth most common cancer globally,remains the leading cause of cancer deaths worldwide.Inflammati...
【关键词】 Gastric cancer; inflammation-induced tumorigenesis; multi-omics;
【中文期刊】 章子怡 王棨临 等 《遗传》 2024年46卷10期 820-832页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 乳腺癌的高度异质性导致其治疗及预后评估较为复杂.治疗方案的选择受到肿瘤亚型、病变分级、基因型等多种因素的影响,因此需要制定个体化治疗策略.患者的预后效果因病情不同而产生显著差异.作为人工智能的一个重要分支,机器学习能高效处理海量数据,并实现...
【中文期刊】 杨品 任振华 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷7期 1196-1213页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 多模态组学数据的联合运用在揭示细胞异质性和解析细胞命运调控机制方面具有重要意义,目前已有多种方法被开发,用于处理不同组学模态数据的整合.本研究通过对应用于不同整合任务的多种数据整合方法进行性能评测,为相关领域的研究提供有益参考.使用6个联合...
【中文期刊】 师国京 李灵梅 等 《中国卫生统计》 2024年41卷3期 376-381页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 针对网络增强的相似网络融合(network enhancement fusion,ne-SNF)方法先融合不同组学网络,再对融合后的网络降噪,忽略了不同组学相似网络噪声对融合网络影响的问题,本文提出了改进的网络增强融合(im-prov...