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          【中文期刊】 黄丽红  荀鹏程  等 《中国卫生统计》 2006年23卷4期 315-318页ISTICPKUCSCD

          【摘要】 目的 探讨系统发育在SARS病毒分类中的应用.方法 系统发育分析是通过构建系统树来评价物种或分子之间进化关系的一种方法 .本文采用目前比较成熟、应用较为广泛的系统发育分析软件PHYLIP,根据GenBank中14个冠状病毒、17个SARS病...

          【关键词】 系统树PHYLIP软件SARS病毒

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          【中文期刊】 冯达  魏趁  等 《畜牧兽医学报》 2025年56卷10期 4947-4962页

          【摘要】 旨在解析雷州山羊的群体遗传多样性和遗传结构,为其种质资源的保护与可持续利用提供理论依据.本研究采集了 20只雷州山羊的血液样本进行了全基因组重测序,平均测序深度约为10×,同时从NCBI数据库下载了 43头山羊的全基因组数据(包括云上黑山羊...

          【关键词】 雷州山羊全基因组重测序遗传多样性

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          【中文期刊】 魏巍  张寿勋  等 《昆明医科大学学报》 2022年43卷5期 33-43页ISTICCA

          【摘要】 目的 调查云南白族民家支系2 323个健康无亲缘关系个体18个STR基因座的遗传多态性,计算群体遗传学参数,建立云南白族民家支系群体的遗传学基础数据,为司法鉴定工作中的亲子鉴定和个体识别提供可靠的科学依据.方法 收集2323份云南白族民家支...

          【关键词】 群体遗传常染色体短串联重复遗传多态性

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          【中文期刊】 徐冲冲  王上  等 《昆明医科大学学报》 2022年43卷10期 153-162页ISTICCA

          【摘要】 目的 研究文山红河地区苗族群体20个常染色体STR基因座的遗传多态性,评估其在该人群中的法医学应用价值,为法医DNA分析和人类遗传研究提供基础数据.方法 采用Chelex-100法提取样本DNA,使用PowerPlex?21试剂盒对该地区2...

          【关键词】 法医遗传学遗传多态性短串联重复

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          【中文期刊】 熊成龙  张志杰  等 《复旦学报(医学版)》 2011年38卷4期 324-328页ISTICPKUCSCDCABP

          【摘要】 目的 分析甲型流感病毒各亚型血凝素基因的系统发育特征,探讨甲型流感病毒血凝素基因的起源与演化规律。方法 从互联网获取甲型流感16个亚型的基因序列资料,运用DNAStar、Clustal X1.83、MEGA 4及PHYLIP 3.67等生物...

          【关键词】 甲型流感病毒血凝素基因进化

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          【学位论文】 作者:韩枫 导师:李明禄   上海交通大学   计算机科学与技术 计算机应用技术(硕士) 2011年

          【摘要】 系统发育分析是生物信息学的重要研究方向,它包含了多种算法,用于序列分析和生成系统发育树.随着序列数据规模的不断增大,人们开始关注这些算法的性能问题,对这些算法的并行化研究也越来越多.PHYLIP作为一个使用广泛的系统发育分析软件包同样面临性...

          【关键词】 PHYLIP软件多核CPU

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          【中文期刊】 马春雷  普雄明  等 《实用皮肤病学杂志》 2009年2卷2期 68-71页ISTIC

          【摘要】 目的 通过对人类疱疹病毒8型(HHV-8)ORF75基因多态性研究,初步探讨其与新疆Kaposi肉瘤的相关性.方法 对25例新疆Kaposi肉瘤患者石蜡包埋组织进行HHV-8 DNA抽提、扩增及双向测序,使用CLUSTALW软件和PHYLI...

          【关键词】 Kaposi肉瘤人疱疹病毒8型ORF75基因

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          【中文期刊】 付瑞敏  蔺芳  等 《广东农业科学》 2012年39卷10期 148-150,154页

          【摘要】 采用18S rRNA对我国常见的4种三肠目涡虫的18S rDNA基因进行序列测定和分析,共获得三肠目2科3属4种的序列,同时结合GenBank中的三肠目18S rDNA序列(22条),以其姐妹群原序列目中的Archimonocelis cr...

          【关键词】 涡虫纲三肠目分子系统发育

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          【中文期刊】 郝宝成  梁剑平  等 《畜牧与兽医》 2011年43卷10期 56-59页

          【摘要】 为进行国内猪戊型肝炎病毒(HEV)衣壳蛋白基因特征研究,参照GenBank中已发表的戊型肝炎病毒核苷酸序列,设计了1对扩增HEV衣壳蛋白(Y)基因的引物,利用RT-PCR等方法成功克隆出HEV甘肃分离株swCH189的Y基因cDNA片段,并...

          【关键词】 猪戊型肝炎病毒衣壳蛋白基因序列分析

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          【中文期刊】 吴静  《江西农业学报》 2010年22卷10期 122-125页

          【摘要】 测定了鲤斜管虫(Chilodonella cyprini)的ITS1-5.8S-ITS2基因序列,使用PHYLIP 3.66软件及MEGA 3.1软件构建了其NJ及UPGMA两种分子系统发育树.结果表明:无论采用何种软件,鲤斜管虫都表现出与...

          【关键词】 鲤斜管虫ITS-5.8S分子系统发育

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