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【中文期刊】 Duong Thanh Tran Nhat Truong Pham 等 《药物分析学报（英文版）》 2025年15卷8期 1873-1886页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Peptide-based therapeutics hold great promise for the treatment of various diseases;however,their clinical application i...
【关键词】 Peptide toxicity；Hybrid framework；Multi-head attention；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Danyang Xiong Yongfan Ming 等 《药物分析学报（英文版）》 2025年15卷6期 1334-1343页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 The identification and optimization of mutations in nanobodies are crucial for enhancing their thera-peutic potential in...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Zihan Zhou Yang Yu 等 《药物分析学报（英文版）》 2025年15卷8期 1800-1809页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Current experimental and computational methods have limitations in accurately and efficiently classi-fying ion channels ...
【关键词】 Ion channel；Artificial intelligence；Representation learning；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Yintao Zhang Lingyan Zheng 等 《药物分析学报（英文版）》 2025年15卷8期 1765-1773页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Drug development encompasses multiple processes,wherein protein subcellular localization is essential.It promotes target...
【关键词】 Protein subcellular location；Pharmaceutical research；Protein large language model；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙雨楠 叶川 等 《生理科学进展》 2025年56卷3期 202-209页ISTICPKUCA
【摘要】 蛋白质是生命活动的物质基础.蛋白质的功能取决于其空间结构,因此解析蛋白质的空间结构对于理解其功能至关重要.人工智能(artificial intelligence,AI)模型的利用极大地推进了蛋白质空间结构预测算法的开发,AlphaFold...
【关键词】 蛋白质结构预测；AlphaFold2；蛋白质语言模型；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 高正 高向东 等 《中国药科大学学报》 2025年56卷3期 368-375页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为解决抗原肽与特定MHC-II类分子的结合亲和力预测模型性能较低,无法满足临床需求的现状,提出一种基于深度学习的MHC-II类分子与多肽亲和力的预测模型T5MHCII.该模型通过迁移学习的方法,利用蛋白质语言模型ProtT5已学习到的知识对...
【关键词】 主要组织相容性复合体；亲和力预测；深度学习；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 Jiawei Luo Kejuan Zhao 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2024年22卷6期 131-144页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Functional peptides are short amino acid fragments that have a wide range of beneficial functions for living organisms.T...
【关键词】 Multi-functional peptide discovery；Protein language model；Graph attention network；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 宋成治 林一瀚 《合成生物学》 2025年6卷3期 617-635页
【摘要】 定向进化是合成生物学领域的核心底层技术之一.通过在实验室中模拟自然界发生的进化过程,定向进化利用功能筛选从大量的突变序列文库中不断获得性能提升的蛋白序列,帮助实现野生型蛋白难以实现的功能.近年来不断发展的机器学习、蛋白语言模型等人工智能(a...
- 概要：
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【中文期刊】 李明辰 钟博子韬 等 《合成生物学》 2025年6卷3期 636-650页
【摘要】 2025年年初,杭州深度求索人工智能基础技术研究有限公司发布并开源了其自主研发的DeepSeek-R1对话大模型.该模型具备极低的推理成本和出色的思维链推理能力,在多种任务上能够媲美甚至超越闭源的GPT-4o和o1模型,引发了国际社会的高度...
【关键词】 大语言模型；AI蛋白质；深度自注意力变换网络；
- 概要：
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【中文期刊】 张锦雄 孟雪莉 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷8期 1303-1320页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 在蛋白质设计领域,人工智能技术的应用已经催生了一些大模型.蛋白质的计算设计是指利用计算机技术辅助确定蛋白质的氨基酸序列,实现预设的结构和功能的过程.基于计算的蛋白质设计可进行改造设计或从头设计.特定功能的蛋白质快速生成,对生物医学研究、药物...
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