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【中文期刊】 《中国神经再生研究(英文版)》 2010年5卷8期 572-578页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 BACKGROUND:β-secretase (β-site APP cleavage rate-limiting enzyme, BACE) has been proposed as a promising therapeutic tar...
【关键词】 Alzheimer's disease；β-secretase；QM/MM；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 赵媛 曹泽星 《物理化学学报》 2017年33卷4期 691-708页
【摘要】 酶催化包括底物到活性区的输运、选择催化化学反应及产物释放等复杂过程,由于复杂的蛋白质环境效应,任一化学和非化学过程都有可能是决定酶活性的关键步骤.为了全面认识酶催化活性,我们对几类酶催化过程进行了广泛的组合量子/分子力学(QM/MM)和经典...
- 概要：
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【中文期刊】 冯荣楷 刘若云 等 《计算机与应用化学》 2017年34卷9期 669-672页
【摘要】 目的:评估QM/MM方法和Surflex-Dock分子对接程序对DNA-配体复合物模拟的准确性.方法:从蛋白质数据库(ProteinData Bank)下载DNA-配体复合物的三维结构,利用计算机辅助药物设计的分子对接程序Surflex-D...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 段新丽 张欣 等 《高等学校化学学报》 2015年36卷12期 2491-2496页
【摘要】 采用QM(PM3)/MM分子动力学(MD)方法模拟了烟酰胺酶催化烟酰胺水解脱氨形成烟碱酸的反应过程.计算结果表明,硫的亲核进攻是整个反应的速率控制步骤.当改变Ala155所在Loop区的位置,在亲核进攻时,底物能够自由旋转,可以加速亲核进攻...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 赵云飞 《科技创新导报》 2014年11期 97-100页
【摘要】 半胱氨酸蛋白酶是人体自身产生的重要酶类物质，它广泛的参与人体新陈代谢和蛋白的水解。但过量产生的半胱氨酸蛋白酶会导致骨质疏松和乳腺癌。腈基类化合物分子是一种新发现的具有抑制半胱氨酸蛋白酶作用的靶向药物分子，高效且低副作用。但是它的抑制机理一直...
【关键词】 半胱氨酸蛋白酶；组织蛋白酶K；量子力学/分子力学(Q M/M M)；
- 概要：
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【中文期刊】 王哲 王普 等 《化工进展》 2013年10期 2475-2479,2485页
【摘要】 脂肪酶是一种重要的生物催化剂，其来源广泛，可在水相甚至非水介质中催化多种反应，并表现出很高的立体选择性和催化活性。有关脂肪酶的应用和基础研究备受重视，特别是脂肪酶催化机理和结构功能关系成为近年来研究热点，基于现代计算机技术的分子模拟计算在相...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Sarawoot Somin Don Kulasiri 等 《Quantitative Biology》 2024年12卷4期 414-432页MEDLINECSCDBP
【摘要】 The insulin‐degrading enzyme (IDE) plays a significant role in the degradation of the amyloid beta (Aβ), a peptide found...
【关键词】 electrostatic interactions；molecular dynamic simulation；QM/MM calculation method；
- 概要：
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【中文期刊】 卢俊彦 胡璐璐 等 《中国细胞生物学学报》 2016年38卷1期 1-6页MEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 基因组中胞嘧啶的甲基化修饰是重要的表观遗传标记,其动态变化参与了多种重要生物学过程.TET(ten-eleven translocation)家族蛋白质介导了5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)的连续氧化,相继生成5-...
- 概要：
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【外文期刊】 Arodola, Olayide A. ; Soliman, Mahmoud E. S. ; 《Future medicinal chemistry》 2018年10卷1期 5-26页
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Sartorelli, Jaqueline ; de Castro, Alexandre A. ; 等 《Medicinal chemistry research: an international journal for rapid communications on design and mechanisms of action of biologically active agents》 2016年25卷11期 2521-2533页SCISCIEMEDLINE
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