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【中文期刊】 高世乐 王启钊  《计算机工程与应用》 2012年48卷11期 26-31页

【摘要】 基于Rivas和Eddy(R&E)RNA二级结构类的图语法,提出了一种计算RNA二级结构图亏格的动态生成算法.与已有的基于判定的亏格计算方法相比,该算法的优点主要有两点:一是提高了计算亏格的效率,二是可以实现枚举小亏格RNA二级结构图.

【关键词】 假结； RNA二级结构； 拓扑分类；

【中文期刊】 庄鑫 周舒扬  等 《中国农学通报》 2010年26卷17期 70-74页

【摘要】 利用真菌核糖体核苷酸序列信息及RNA二级结构特征对针层孔菌属(Phellinus)复合种进行分类学研究.通过分析国内外已报道的一些针层孔菌属及其近缘属真菌核糖体DNA内转录间隔区(Internal transcribed spacer,IT...

【关键词】 针层孔菌属； ITS； RNA二级结构；

【中文期刊】 尹正胜 崔梦琦  等 《淮北师范大学学报（自然科学版）》 2023年44卷2期 63-69页

【摘要】 非编码RNA功能通常与其结构密切相关,准确预测RNA的二级结构有助于揭示RNA的功能.在传统的遗传算法基础上,结合RNA二级结构和假结的特点,提出一种多解并行的遗传算法预测RNA二级结构和假结.首先构建茎区池和初始解集;然后根据RNA二级结...

【关键词】 遗传算法； 多解并行； RNA二级结构；

【中文期刊】 李生强 谢冰颖  等 《中国骨质疏松杂志》 2021年27卷3期 359-363页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 探讨绝经后骨质疏松症差异表达lncRNAs及其靶基因抑瘤素M(oncostatin M,OSM)在绝经后骨质疏松症外周血的表达及其意义.方法 在前期lncRNA-mRNA芯片检测绝经后骨质疏松症差异lncRNAs并进行共表达分析的基础...

【关键词】 长链非编码RNA； 抑瘤素M； 绝经后骨质疏松症；

【中文期刊】 赵英杰 王正志  《生物化学与生物物理进展》 2009年36卷9期 1222-1228页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 多序列比对是计算分子生物学的经典问题,也是许多生物学研究的重要基础步骤.RNA作为生物大分子的一种,不同于蛋白质和DNA,其二级结构在进化过程中比初级序列更保守,因此要求在RNA序列比对中不仅要考虑序列信息,更要着重考虑二级结构信息.提出了...

【关键词】 RNA多序列； 结构比对； 二级结构；

【中文期刊】 陈翔 卜东波  等 《生物化学与生物物理进展》 2009年36卷1期 115-121页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 RNA的二级结构预测是生物信息学中一个已经有30多年历史的经典问题,基于最小自由能模型(MFE)的优化算法是使用最为广泛的方法.但RNA结构中假结的存在使MFE问题理论上成为一个NP-bard问题,即使采用动态规划等优化算法也会面临时间复杂...

【关键词】 RNA二级结构预测； 假结； NP-hard；

【中文期刊】 孙道春 伯晓晨  等 《生物化学与生物物理进展》 2004年31卷4期 299-303页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 单股正链RNA病毒种类繁多,其宿主涉及人、动物、植物,对人畜健康和农业经济生产都有重大的影响.病毒基因组3'UTR内的序列形成茎环、假结、TLS等高级结构,既可以作为顺式元件,又可以结合蛋白质反式因子,对病毒的转录、复制、翻译都有调控作用....

【关键词】 单股正链RNA病毒； 3'UTR； 二级结构；

【中文期刊】 张静 石秀凡  等 《生物化学与生物物理进展》 2001年28卷4期 523-527页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 形成真核生物mRNA 3′末端的多聚腺苷（poly(A)）作用涉及前体mRNA下游的三个元件：效率元件（EE）、定位元件（PE）以及实际的剪切和poly(A)作用位点，实验研究提出了一些EE和PE的碱基序列组成.对180个Yeast基因下游...

【关键词】 Yeast； 多聚腺苷作用信号,mRNA二级结构；

【中文期刊】 陈莉 金由辛  等 《生物化学与生物物理进展》 2000年27卷6期 668-671页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 随着RNA功能多样性的发现,RNA研究领域日益受到重视,同时RNA序列、二级结构和三维模建数据已有较大增长.利用这些数据可以有效地搜索结构信息和进行功能提示.与此同时,计算科学的优越性以及全球网络的发展促进了RNA相关数据库和网络站点的建设...

【关键词】 网络浏览器； 数据库； RNA；

【中文期刊】 张彦 刘次全  《生物化学与生物物理进展》 1999年26卷3期 265-269页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 利用p53 C端118个氨基酸的mRNA二级结构和Chou-Fasman蛋白质二级结构预测原则,预测p53蛋白质C端289～325为卷曲肽段,368～393段包括两段螺旋结构: α1 368～373, α2 381～388.其中三段已知的蛋...

【关键词】 p53蛋白质； 二级结构预测； mRNA二级结构；