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【中文期刊】 朱大强 李存  等 《生物信息学》 2011年09卷2期 106-112页 ISTIC

【摘要】 新一代测序平台的诞生推动了对全基因组鸟枪法测序数据的拼接算法和软件的研究,自2005年以来多种用于高通量测序的序列拼接软件已经被开发出来,并且在不断地进行改进以提高拼接效果.本文利用目前广泛使用的高通量测序拼接软件Velvet、AbySS、...

【关键词】 第二代测序； 从头拼接； Velvet；

【中文期刊】 刘新星 陈超  《中国生物工程杂志》 2011年31卷7期 45-53页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 为了促进对四倍体拟南芥(A.suecica)的研究,阐明多倍体植物在染色体加倍过程中遗传物质的变化,从而在分子层面上解释多倍体植物的环境适应和进化机制,描述了一套基于第二代测序技术的转录组短序列组装和生物信息学分析方法.通过对23 000 ...

【关键词】 Arabidopsis suecica； 转录组组装； SOAPdenovo；

【中文期刊】 陈天杰 李玉铎  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷12期 5162-5173页

【摘要】 [目的]了解大庆地区奶牛群体犊牛肠道病毒的种群组成及遗传变异情况,为犊牛腹泻病毒性病原的检测与防控技术研究提供理论依据.[方法]于大庆周边奶牛场,采集155份犊牛粪便样品,随机分为6个腹泻样品池和3个临床无腹泻症状样品池.提取总核酸,基于I...

【关键词】 犊牛肠道病毒； 病毒宏基因组学； 高通量测序；

【中文期刊】 范燕迪 杨丹娇  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷9期 3836-3847页

【摘要】 为了解我国川西高原地区藏猪呼吸道疾病综合征(porcine respiratory disease complex,PRDC)相关病毒的种类和流行情况,本研究从四川省甘孜藏族自治州地区采集藏猪呼吸道样本共计119份,其中健康藏猪鼻拭子66份...

【关键词】 藏猪； 呼吸道疾病综合征； 病毒宏基因组；

【中文期刊】 吴生亮 叶子兰  等 《药物生物技术》 2022年29卷1期 8-15页 ISTICCA

【关键词】 金乡大蒜； 非脱羧勒克氏菌； 邻苯二酚；

【外文期刊】 Gupta, Sachin Kumar ; Raza, Shahbaz ; 等 《Genes and genomics》 2019年41卷9期 1077-1083页

【关键词】 Plasmid metagenome; MEGAHIT; IDBA-UD;

【外文期刊】 Yanyuan,Lei ; Xun,Zhu ; 等 《Gene》 2014年533卷1期 180-7页 SCIMEDLINECABP

【关键词】 ABC; ABC transporters; ALP;

【外文期刊】 Sachin Kumar,Gupta ; Shahbaz,Raza ; 等 《Genes & genomics》 2019年41卷9期 1077-1083页 SCIMEDLINE

【关键词】 IDBA-UD; MEGAHIT; Plasmid metagenome;

【外文期刊】 Ni, Peixiang ; Dai, Wenkui ; 等 《Current Bioinformatics》 2017年12卷6期 498-508页

【关键词】 assembly; bacterium; gap closure;