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【中文期刊】 Min Su Tao Pan 等 《军事医学研究（英文版）》 2023年10卷4期 529-553页
【摘要】 The application of single-cell RNA sequencing(scRNA-seq)in biomedical research has advanced our understanding of the pat...
【关键词】 Single-cell RNA-sequencing(scRNA-seq)；Data analysis；Biomedical research；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 Peng Ni Kaixin Guo 等 《生物医学与环境科学（英文版）》 2025年38卷4期 416-432页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Objective To identify prognostic genes associated with lysosome-dependent cell death(LDCD)in patients with gastric cance...
【关键词】 Gastric cancer；Lysosomal dependent cell death；Single-cell analysis；
- 概要：
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【中文期刊】 罗玉燕 罗晓敏 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2025年41卷11期 1579-1589页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 单细胞染色质可及性测序(Single-cell assay for transposase-accessible chromatin sequencing,scATAC-seq)是解析细胞异质性与基因调控网络的重要技术,在表观遗传研究中应用...
- 概要：
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【中文期刊】 傅东升 艾克热木江·木合热木 《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4379-4388页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:多指畸形患者中参与Heghog信号通路的一些转录因子发生异常表达,这些转录因子调控大量靶基因的表达,从而影响细胞的功能.目的:通过单细胞转录组分析多指畸形患者的转录组特征.方法:从GEO公共数据库中下载4例多指畸形患者细胞间质和上皮细...
- 概要：
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【中文期刊】 杨子麒 于昊祯 等 《心脏杂志》 2025年37卷4期 436-443页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨汉坦病毒(Hantan virus,HTV)感染对血管内皮细胞及外周血细胞基因表达的影响和潜在的病理机制以及可能的治疗靶点.方法 通过基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)分别获取HTV数据集...
- 概要：
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【中文期刊】 任彦学 赵琳琳 等 《中国实验诊断学》 2025年29卷6期 634-642页ISTIC
【摘要】 目的 应用单细胞测序技术探索阿尔茨海默病的发病机制.方法 从单细胞转录组数据库下载疾病组及对照组数据,下载后进行数据质控,利用Seurat软件进行数据整合、聚类,利用T-分布随机邻域嵌入和一致流形逼近与投影软件进行图的可视化.利用Singl...
- 概要：
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【中文期刊】 罗琴琴 雷锦志 《生物信息学》 2025年23卷1期 1-27页ISTIC
【摘要】 近年来,高通量单细胞测序技术为生物学研究带来了深刻的新发现,单细胞 RNA 测序技术的快速发展使得人们能够以单个细胞的分辨率定量研究细胞全基因组的转录水平.如何从高维的单细胞 RNA 测序数据中获取关于细胞和基因组的有用信息,是单细胞 RN...
【关键词】 单细胞转录组测序数据；数据预处理；聚类分析；
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【中文期刊】 王艳妮 李佳 《遗传》 2024年46卷10期 807-819页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 单细胞DNA甲基化测序技术近年来取得了飞速发展,在揭示细胞间异质性及表观遗传学调控机制方面发挥着重要作用.随着测序技术的进步,单细胞甲基化数据的质量与数量也在不断提高,标准化的预处理流程与合适的分析方法对确保数据的可比性与结果的可靠性尤为关...
【关键词】 单细胞DNA甲基化测序；表观遗传学；预处理；
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【中文期刊】 Matthew Brendel Chang Su 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷5期 814-835页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Single-cell RNA sequencing(scRNA-seq)has become a routinely used technique to quan-tify the gene expression profile of t...
【关键词】 Single-cell RNA sequencing；Single-cell sequencing；Deep learning；
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【中文期刊】 翁军华 《浙江实用医学》 2024年29卷4期 286-294页
【摘要】 目的 在通过分析多组转录组和单细胞数据集,深入探究扩张性心肌病(DCM)的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点.方法 (1)数据获取与预处理.从GEO数据库获取多个转录组和单细胞数据集,并利用SVA软件去除批次效应.(2)差异基因分析.通过PCA...
- 概要：
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