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【中文期刊】 Xue Sun Wei Zhang  等 《遗传学报》 2025年52卷1期 93-104页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Recent advances in spatially resolved transcriptomics(SRT)have provided new opportunities for charac-terizing spatial st...

【关键词】 Spatial domain identification； Spatially resolved transcriptomics； Multi-head graph attention networks；

【中文期刊】 冯爱静 王文淼  等 《生物医学工程研究》 2024年43卷6期 468-474页 ISTIC

【摘要】 为缓解空间转录组学数据因高离散性、稀疏性和分辨率受限导致空间域识别精度低的问题,基于多尺度邻域特征融合策略,本研究提出了一种空间域识别方法stMSAA.本研究在人类背外侧前额叶皮层数据集和人类乳腺癌数据集上进行实验,调整兰德系数、归一化互信...

【关键词】 空间转录组； 空间域识别； stAA；

【外文期刊】 Runqing,Wang ; Qiguo,Dai ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2024年26卷1期 SCIMEDLINEBP

【关键词】 hybrid neighbor graph; self-supervised graph representation learning; spatial domain identification;

【外文期刊】 Xue,Sun ; Wei,Zhang ; 等 《Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao》 2025年52卷1期 93-104页

【关键词】 Geometric contrastive learning; Graph augmentation; Multi-head graph attention networks;

【外文期刊】 Wei,Liu ; Bo,Wang ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2024年25卷6期 SCIMEDLINEBP

【关键词】 graph convolutional networks; self-supervised contrastive learning; spatial domain identification;

【外文期刊】 Jiazhang,Cai ; Huimin,Cheng ; 等 《Cell reports methods》 2024年4卷11期 100886页

【关键词】 CP: systems biology; Visium; deep learning;

【外文期刊】 Chuanchao,Zhang ; Xinxing,Li ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷4期 SCIMEDLINEBP

【关键词】 self-representation learning; spatial domain identification; spatial information;

【外文期刊】 Siyao,Wu ; Yushan,Qiu ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷6期 SCIMEDLINEBP

【关键词】 contrastive learning; domain identification; spatial transcriptomics;

【外文期刊】 Jing,Gao ; Kai,Hu ; 等 《Methods (San Diego, Calif.)》 2023年220卷 61-68页 SCIMEDLINECABP

【关键词】 Batch effect; Convolutional neural network; Graph neural network;

【外文期刊】 Jiayuan,Ding ; Renming,Liu ; 等 《Genome biology》 2024年25卷1期 72页 SCIMEDLINE

【关键词】 Benchmarking; Cell type annotation; Cell type deconvolution;