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【中文期刊】 行冰楠 梁莹莹 等 《广西植物》 2025年45卷4期 716-729页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为探究广藿香(Pogostemon cablin)叶绿体基因组的结构特征,比较不同来源广藿香叶绿体基因组的差异,该研究利用DNBSeq测序平台对广藿香全基因组进行测序,使用GetOrganelle组装完整的广藿香叶绿体基因组,通过CPGAV...
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【中文期刊】 卢頔 郑若函 等 《现代畜牧兽医》 2024年12期 1-7页
【摘要】 试验旨在分析并比较弓形虫(Toxoplasma gondii)与部分顶复门原虫、模式生物的硫氧还蛋白(thioredoxin,Trx)密码子的使用偏好性.试验获取弓形虫、疟原虫、新孢子虫、球虫、小鼠、大鼠、斑马鱼、果蝇、人等的Trx碱基序列...
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【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2011年09卷6期 218-228页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Multivariate analysis of codon and amino acid usage was performed for three Leishmania species,including L.donovani,L.in...
【关键词】 Leishmania；relative synonymous codon usage；multivariate analysis；
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【中文期刊】 《浙大学报（英文版）（B辑：生物医学和生物技术）》 2008年9卷9期 667-674页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Begomoviruses are single-stranded DNA viruses and cause severe diseases in major crop plants worldwide. Based on current...
- 概要：
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【中文期刊】 江澎 孙啸 等 《遗传学报》 2007年34卷3期 275-284页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 比较分析了嗜热泉生古细菌(Aeropyrum pernix K1)和其他两种系统发育相关的泉古菌[嗜气菌(Pyrobaculum aerophilum str.IM2)和嗜硫菌(Sulfolobus acidocaldarius DSM 6...
【关键词】 密码子使用偏向性；密码子使用相对概率(RSCU)；嗜热泉生古细菌(Aeropyrum pernix K1)；
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【中文期刊】 马相如 肖少波 等 《遗传学报》 2005年32卷6期 616-624页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 由于伪狂犬病病毒(PRV)中G+C含量高达74%,至今尚没有一个毒株完成全基因组测序.对已知的68个PRV基因编码区序列碱基组成及密码子使用现象进行了统计分析,结果发现PRV基因中存在非常强的密码子使用偏差.所有68个PRV基因编码区密码子...
【关键词】 伪狂犬病病毒；G+C含量；同义密码子相对使用度(RSCU)；
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【中文期刊】 王鹏良 杨利平 等 《广西植物》 2018年38卷2期 135-144页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了利用叶绿体基因工程技术改良普通油茶的重要经济性状,该研究以普通油茶叶绿体全基因组序列为材料,从中筛选出51条长度大于300 bp且以ATG起始的非重复CDS(Coding DNA Sequence)为对象,利用CodonW软件分析其密码...
- 概要：
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【中文期刊】 唐晓芬 陈莉 等 《基因组学与应用生物学》 2013年5期 660-666页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 在基因组学水平上研究密码子使用偏性模式、成因并分析进化过程中的选择压力在基因组学研究中有重要意义。文章概述了目前提出的密码子使用偏性的量化方法及实现原理。目前研究发现：有些量化密码子偏性的方法受高表达基因参考数据集未完全注释的限制，不同密码...
- 概要：
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【中文期刊】 许育铭 齐婷 等 《东南大学学报（英文版）》 2021年37卷2期 177-183页
【摘要】 为探索同义密码子对RNA G-四联体(rG4)形成的适应效应,利用G4 Hunter算法搜寻5类真核生物mRNA蛋白编码区的rG4结构.通过对比天然序列和随机序列,评估rG4结构对同义密码子的选择偏好,分析影响rG4形成的因素,检验基因特定...
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【中文期刊】 马冲 祖颖 等 《生命科学研究》 2018年22卷2期 122-128页ISTICCA
【摘要】 密码子适应指数(codon adaptation index, CAI)测量的是生物体内某个基因所用密码子与高表达基因所用密码子的相符合程度,是反映密码子偏好性的一个重要指标.文章根据拟氨基酸编码方法首次提出拟密码子适应指数(quasi-c...
【关键词】 密码子适应指数(CAI)；拟氨基酸编码方法；拟密码子适应指数(Q-CAI)；
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