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【中文期刊】 李爱杰 姚祖福 等 《广东化工》 2023年50卷16期 237-240页
【摘要】 目前药物化学实验偏有机合成技能的培养,忽视了药物化学课程的主要内容.因此我们尝试在药物化学实验课程中构建Oseltamivir carboxylate与神经氨酸酶的分子对接虚拟仿真实验,帮助学生理解药物与靶蛋白的作用方式,提高学习兴趣.本研...
【关键词】 药物化学;AutoDock vina;分子对接;
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【中文期刊】 陈千姿 王晨 等 《蛇志》 2023年35卷2期 137-143页
【摘要】 目的 基于分子对接方法筛选徐长卿抑制尖吻蝮蛇毒金属蛋白酶的有效组分.方法 使用AutoDock Vina软件对徐长卿[Cynanchum paniculatum(Bunge)Kitag]中化合物与尖吻蝮蛇(Deinagkistrodon a...
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【中文期刊】 谭相端 吕良 《广东化工》 2022年49卷11期 222-224页
【摘要】 在药学本科生的药物设计学课程中,以细菌RNA聚合酶抑制剂的虚拟筛选为例,利用AutoDock vina软件对小分子化合物库进行分子对接虚拟筛选,用PyMOL和LigPlot软件进行结果分析.该教学案例的设计可以帮助学生理解基于分子对接的药物...
【关键词】 教学改革;分子对接;AutoDock vina软件;
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【中文期刊】 张媛 刘雨桐 等 《生物信息学》 2015年4期 251-256页ISTIC
【摘要】 靶标确证是老药新用、药物毒副作用研究的关键。基于分子对接方法AutoDock Vina和内部构建的疾病靶标数据库,采用分布式架构,构建了反向虚拟筛选平台。应用该平台对药物吡斯的明进行靶标确证,最终成功找到其靶标乙酰胆碱酯酶,验证了平台的实用...
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【中文期刊】 宋新蕊 李达 等 《生物信息学》 2014年4期 300-304页ISTIC
【摘要】 先导化合物发现是创新药物研发的最重要环节之一。针对目前海量功能不明确的小分子化合物,本文构建了一个用来实现快速发现先导化合物,有效降低药物研发成本的计算机辅助药物筛选平台。该平台采用分布式架构思想,集成了AutoDock Vina和多个小分...
【关键词】 虚拟筛选;超算平台;AutoDock Vina;
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【中文期刊】 马继征 刘绍能 等 《吉林中医药》 2014年34卷6期 565-567页ISTIC
【摘要】 《伤寒论》和《金匮要略》大量条文涉及腹痛的论治,根据腹痛的病因病机、疼痛性质、腹痛部位等特点,在选方用药、配伍禁忌、煎煮炮制、将养调理各环节,章法鲜明,进退有度.强调痛之部位,治有侧重,上腹多用清法,中腹多用温法、清泻法或清温并用,下腹(少...
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【中文期刊】 黄勇 陈晨 等 《生物信息学》 2012年10卷4期 248-253页ISTIC
【摘要】 随着大量与细菌耐药相关的基因的发现和其表达蛋白结构的成功测定,从已有的化合物中通过计算机模拟方法筛选对耐药蛋白靶点有作用的候选化合物,成为了药物发现的一个标准途径.虚拟筛选在耐药基因抑制剂的发现中可以提高效率、降低实验成本.本文介绍了Aut...
【关键词】 虚拟筛选;分子对接;Autodock Vina;
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【中文期刊】 李海燕 王慧然 等 《中草药》 2024年55卷9期 3116-3126页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 采用HPLC法对珠子参Panax japonicus中多指标成分进行定量检测,建立主成分分析(principal component analysis,PCA)、正交偏最小二乘判别分析(orthogonal partial least...
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【中文期刊】 朱廷廷 李甫 等 《应用与环境生物学报》 2016年22卷1期 70-74页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为了解人参叶皂苷类化学成分,寻找其尚未发现的皂苷,采用正反相硅胶柱层析和反相制备液相色谱等多种方法进行分离纯化.从人参叶中分离得到12个皂苷类化合物,用波谱方法鉴定为越南参皂苷R3(1)、越南参皂苷R4(2)、越南参皂苷R8(3)、人参皂苷...
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【中文期刊】 王晓双 黄韬 等 《中国中药杂志》 2016年41卷8期 1498-1503页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 该研究旨在探讨越南人参皂苷R7(R7)对LPS及TNF-α联合诱导下大鼠星形胶质细胞C6的激活抑制作用及机制.取对数生长的C6细胞,在无血清的DMEM培养基中饥饿培养24h后,使用0.25%胰酶将其消化收集,按1.5×106个/mL密度接入...
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