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【中文期刊】 刘一卜 汤磊 等 《山东医药》 2024年64卷3期 44-50页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于增强采样构建的隐式马尔可夫状态模型,分析胰高血糖素样肽1受体(GLP-1R)激动剂PF-06882961激活GLP-1R的机制.方法 从PDB数据库中下载GLP-1R晶体结构(PDBID:6X1A),基于该晶体结构构建PF0688...
【关键词】 胰高血糖素样肽1受体激动剂； PF-06882961； 胰高血糖素样肽1受体；
【中文期刊】 周超 石婷 等 《高等学校化学学报》 2017年38卷10期 1813-1821页
【摘要】 通过生物信息学分析、量化计算优化、CAVER和MDpocket预测、随机加速分子动力学及伞状抽样动力学模拟等方法,对喹啉加氧酶(HOD)中的氧气扩散途径进行了计算预测.结果表明,氧气在HOD中的反应位点包埋在蛋白内部,而HOD中有数条可能的...
【中文期刊】 Hong-li Liu Hai-yang Zhong 等 《中国药理学报（英文版）》 2024年45卷11期 2441-2449页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The vasopressin V2 receptor(V2R)is a validated therapeutic target for autosomal dominant polycystic kidney disease(ADPKD...
【关键词】 vasopressin V2 receptor(V2R)； tolvaptan； binding pathway；
【中文期刊】 Mingwei Li Guanglin Chen 等 《定量生物学（英文版）》 2023年11卷1期 72-81页
【摘要】 Background:N6-methyladenosine(m6A)modifications of mRNA and long non-coding RNA(lncRNAs)are known to play a significant ...
【关键词】 RNA methylation； YTH-m6A3 RNA； principal component analysis(PCA)；
【会议论文】Michael E Johnson 第十七届国际生物物理大会;第十二届中国生物物理大会 2011年
【摘要】 The human Severe Acute Respiratory Syndrome(SARS-CoV) and the NL63 coronaviruses are human respiratory pathogens for whi...
【外文期刊】 Bhattacharya, Supriyo ; Zhang, Mingfeng ; 等 《Biophysical Journal》 2022年121卷22期 4342-4357页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 ACCELERATED MOLECULAR-DYNAMICS; CARBOHYDRATE-RECOGNITION DOMAIN; PROTEIN;
【外文期刊】 Burendahl,S. ; Danciulescu,C. ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2009年77卷4期 842-856页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Ligand unbinding; Molecular dynamics simulation; Nuclear receptor;
【外文期刊】 Rodriguez-Bussey, Isela G. ; Doshi, Urmi ; 等 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2016年105卷1期 35-42页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 accelerated molecular dynamics; RaMD-db; cyclophilin A;
【外文期刊】 Ostermeir, Katja ; Zacharias, Martin ; 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2014年82卷12期 3410-3419页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 molecular simulations; global protein dynamics; conformational sampling;
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