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【中文期刊】 刘一卜 汤磊 等 《山东医药》 2024年64卷3期 44-50页ISTICCA
【摘要】 目的 基于增强采样构建的隐式马尔可夫状态模型,分析胰高血糖素样肽1受体(GLP-1R)激动剂PF-06882961激活GLP-1R的机制.方法 从PDB数据库中下载GLP-1R晶体结构(PDBID:6X1A),基于该晶体结构构建PF0688...
【关键词】 胰高血糖素样肽1受体激动剂；PF-06882961；胰高血糖素样肽1受体；
- 概要：
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【中文期刊】 周超 石婷 等 《高等学校化学学报》 2017年38卷10期 1813-1821页
【摘要】 通过生物信息学分析、量化计算优化、CAVER和MDpocket预测、随机加速分子动力学及伞状抽样动力学模拟等方法,对喹啉加氧酶(HOD)中的氧气扩散途径进行了计算预测.结果表明,氧气在HOD中的反应位点包埋在蛋白内部,而HOD中有数条可能的...
- 概要：
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【中文期刊】 俞伟 宁璐璐 等 《食品与生物技术学报》 2017年36卷10期 1101-1105页
【摘要】 通过生物大分子计算平台对分子动力学的模拟运算,计算值可以描述分子的运动轨迹,从而揭示原子间的内在关系,但这一过程较为复杂且昂贵.作者研究了较低投入下大分子计算平台的构建与优化,在并行GPU条件和CUDA体系下使用AMBER软件包完成分子动力...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Hong-li Liu Hai-yang Zhong 等 《中国药理学报（英文版）》 2024年45卷11期 2441-2449页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The vasopressin V2 receptor(V2R)is a validated therapeutic target for autosomal dominant polycystic kidney disease(ADPKD...
【关键词】 vasopressin V2 receptor(V2R)；tolvaptan；binding pathway；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 William Sinko ; Steffen Lindert ; 等 《Chemical biology and drug design》 2013年81卷1期 41-49页
【关键词】 accelerated molecular dynamics;computer-aided drug design;ensemble docking;
- 概要：
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【外文期刊】 Yinglong Miao ; Sara E. Nichols ; 等 《Chemical biology and drug design》 2014年83卷2期 237-246页
【关键词】 accelerated molecular dynamics;allosteric sites;FTMAP;
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【外文期刊】 Safieh Tork Ladani ; Donald Hamelberg ; 《Molecular simulation》 2014年40卷10/12期 765-776页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 cyclophilin A;enzyme dynamics;cis–trans isomerisation;
- 概要：
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【外文期刊】 Marianna Bufano ; Mattia Laffranchi ; 等 2022年90卷9期 1714-1720页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Zhang, Yuxiang ; Yin, Xiao-Lan ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2024年42卷3/4期 1940-1951页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Fibroblast growth factor receptor 2;population shift;allosteric communication;
- 概要：
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【外文期刊】 Didac Martí ; Marc Alsina ; 等 2022年193C卷 90-102页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Conformational study;Protein-protein interaction;Accelerated molecular dynamics;
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