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【中文期刊】 李文娟 赵一雷  《高等学校化学学报》 2018年39卷2期 255-262页

【摘要】 运用生物信息学方法分析了各物种漆酶的耐盐性差异,并利用随机加速动力学模拟计算揭示了白腐菌漆酶内部连接三铜活性中心(TNC)的氯离子、氧气和水分子的可能输运通路.生物信息学系统发生树和结构比对分析表明,担子真菌、子囊真菌与细菌漆酶具有较高的结...

【关键词】 漆酶； 耐盐性； 系统发生树；

【中文期刊】 赵媛 曹泽星  《物理化学学报》 2017年33卷4期 691-708页

【摘要】 酶催化包括底物到活性区的输运、选择催化化学反应及产物释放等复杂过程,由于复杂的蛋白质环境效应,任一化学和非化学过程都有可能是决定酶活性的关键步骤.为了全面认识酶催化活性,我们对几类酶催化过程进行了广泛的组合量子/分子力学(QM/MM)和经典...

【关键词】 酶催化； 底物输运； 自由能计算；

【外文期刊】 Bhattacharya, Supriyo ; Zhang, Mingfeng ; 等 《Biophysical Journal》 2022年121卷22期 4342-4357页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 ACCELERATED MOLECULAR-DYNAMICS; CARBOHYDRATE-RECOGNITION DOMAIN; PROTEIN;

【外文期刊】 Burendahl,S. ; Danciulescu,C. ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2009年77卷4期 842-856页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Ligand unbinding; Molecular dynamics simulation; Nuclear receptor;

【外文期刊】 Ostermeir, Katja ; Zacharias, Martin ; 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2014年82卷12期 3410-3419页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 molecular simulations; global protein dynamics; conformational sampling;

【外文期刊】 Klemetti,R. ; Steele,K.M. ; 等 《Journal of Biomechanics》 2014年47卷10期 2263-2268页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Dynamic simulation; Induced acceleration; Muscle contributions;

【外文期刊】 Burdakov AV ; Kudryavtsev AM ; 等 《Plasma physics reports》 2005年31卷4期 292-299页 SCISCIE

【关键词】 WAKE-FIELD ACCELERATION; ULTRARELATIVISTIC BEAM DYNAMICS; ELECTRON-BEAM;

【外文期刊】 Zhang, Qianqian ; Zhao, Nannan ; 等 2022年17卷1/6期 191-205页

【关键词】 Protein-ligand unbinding; enhanced sampling methods; molecular dynamic simulation;

【外文期刊】 Gronkvist, Mikael ; Levin, Britta ; 等 《Aerospace medicine and human performance.》 2018年89卷9期 798-804页

【关键词】 Dynamic flight simulator; fighter jet aircraft; headward acceleration;

【外文期刊】 Simoneau, Gabrielle ; Moodie, Erica E. M. ; 等 2020年39卷29期 4466-4479页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 accelerated failure time; bootstrap; censored data;