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【中文期刊】 吴蔚 张梦洁 等 《兽类学报》 2018年38卷2期 174-182页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 非序列联配的序列分析方法,将序列中特定寡聚核苷酸的kmer统计频率作为特征,在序列间按特征进行比较和分析.这种方法综合考虑了所有变异类型对序列整体特征的影响,因而在组学数据分析上有独特的优势.但是,这类方法在复杂多细胞生物基因组系统发育中的...
- 概要：
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【中文期刊】 曹跃 夏云 等 《四川动物》 2018年37卷3期 261-267页ISTICPKU
【摘要】 动物线粒体基因组发生局部串联复制后,涉及区域具有多基因拷贝、假基因化、大量插入缺失的特点,难以排序和构建基因树.而不依赖排序的聚类方法理论上可用来归纳和展示这类序列的差异,但未见相关评估和运用.本研究选取棘腹蛙Quasipaa boulen...
- 概要：
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【外文期刊】 Ragan, Mark A. ; Chan, Cheong Xin ; 《Journal of Molecular Evolution》 2013年77卷1/2期 1-2页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 EYAL COHEN ; BENNY CHOR ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2012年19卷8期 945-956页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 alignment-free sequence comparison;average common subsequence (ACS) method;reconstructing multicellular eukaryotic phylogeny;
- 概要：
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【外文期刊】 Cheng, Jinkui ; Cao, Fuliang ; 等 《Molecular biology and evolution》 2013年30卷5期 1032-1037页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 alignment-free method;genome phylogeny;tree comparison;
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【外文期刊】 Huang, Hsin-Hsiung ; Yu, Chenglong ; 《Journal of Theoretical Biology》 2016年406卷 61-72页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Alignment-free method;Phylogenetic analysis;Reduced n-gram;
- 概要：
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- 结论：
【外文期刊】 Jovanovic, Jasmina T. ; 2021年16卷10期 1299-1310页
【关键词】 Sequence similarity analysis;alignment-free method;statistically significant repeat;
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【外文期刊】 Luca Pinello ; Giosuè Lo Bosco ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2014年15卷3期 419-430页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 epigenetics;nucleosome;DNA sequence;
- 概要：
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【外文期刊】 Pandit, A. ; Dasanna, A.K. ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2012年62卷2期 756-763页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Alignment-free method;HIV-1 subtypes;Multifractal analysis;
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【外文期刊】 Das, Subhram ; Das, Arijit ; 等 《Genomics》 2020年112卷6期 4701-4714页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Sequence comparison;Evolutionary relationship;Alignment-based method;
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