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                【中文期刊】 Hui Wan  Liang Chen  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2022年20卷5期 939-958页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

                【摘要】 Current cell-type annotation tools for single-cell RNA sequencing(scRNA-seq)data mainly utilize well-annotated source da...

                【关键词】 Cell-type annotationTransfer learningPrivacy preservation

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                【中文期刊】 谢谦  朱颖珊  等 《中南大学学报(医学版)》 2025年50卷2期 167-180页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

                【摘要】 目的:肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是临床上常见的原发性恶性肿瘤之一,病死率位居世界第3.本研究基于基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库筛选出与HCC预后相关的关...

                【关键词】 肝细胞癌生物信息学差异表达基因

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                【中文期刊】 孙熠伟  徐淑坦  《基因组学与应用生物学》 2025年44卷6期 561-577页ISTICPKUCSCDCA

                【摘要】 单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)在揭示细胞异质性方面具有重要意义,但现有细胞类型注释方法存在着跨物种适应性、泛化性、类别不平衡等问题.本文提出了一种基于图注意力网络(graph a...

                【关键词】 图注意力网络(GAT)单细胞转录组测序(scRNA-seq)细胞类型注释

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                【中文期刊】 马尧丹  俞晖  等 《中国兽医杂志》 2025年61卷5期 22-32页PKUCA

                【摘要】 为探究猪瘟病毒(CSFV)感染对猪睾丸支持细胞(ST)mRNA表达谱的影响,本试验以感染CSFV 24和48 h的ST细胞和未感染ST细胞为模型,通过蛋白免疫印迹试验(WB)和间接免疫荧光(IIF)染色检测CSFV E2蛋白的表达;构建4个...

                【关键词】 猪瘟病毒(CSFV)猪睾丸支持细胞mRNA差异表达

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                【中文期刊】 袁佳欣  刘宏德  《生物信息学》 2025年23卷2期 96-110页ISTIC

                【摘要】 细胞类型注释是单细胞RNA测序(scRNA-Seq)分析的基本任务.为了解决处理稀疏数据时出现的性能下降以及计算复杂度较高的问题,本文提出了一种基于深度学习模型Transformer的scRNA-seq数据的细胞类型识别和注释工具,scTr...

                【关键词】 细胞类型注释变换器模型单细胞RNA测序

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                【中文期刊】 贾向飞  曹琨  等 《生物加工过程》 2025年23卷3期 252-261页ISTICCABP

                【摘要】 为了筛选一株具有较高纤维素降解能力的放线菌,以菌株的纤维素水解透明圈大小、羧甲基纤维素酶酶活(CMCase)为指标,筛选酶活较高的菌株,经16 SrDNA法测序鉴定候选菌株NJ-B为淡紫链霉菌(Streptomyces lavenduale...

                【关键词】 纤维素酶链霉菌功能基因注释

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                【中文期刊】 陈金令  陈宇  等 《中国医学物理学杂志》 2025年42卷10期 1328-1336页ISTICCSCD

                【摘要】 针对以卷积神经网络(CNN)为主干的U-Net网络只擅长获取局部特征、感受野受限的问题,提出一种基于CNN和Vision Transformer(ViT)的VLi-net细胞核分割方法.首先,为缓解数据标注成本高、数据数量少等问题,引入文本...

                【关键词】 病理图像细胞核分割文本注释

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                【中文期刊】 曹兴琴  张诗晴  等 《浙江中医药大学学报》 2025年49卷10期 1220-1232页ISTIC

                【摘要】 [目的]通过超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱联用技术(ultra-performance liquid chromatography-quadrupole time-of-flight mass spectrometry,UPLC-Q-...

                【关键词】 大黄缺血性脑卒中超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱联用

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                【中文期刊】 张铭露  温苗  等 《药学前沿》 2024年28卷12期 663-670页ISTICCA

                【摘要】 目的 利用抗体芯片技术考察卵泡刺激素(FSH)在不同时间上对卵巢颗粒细胞(KGN)转化生长因子β(TGF-β)信号通路的影响.方法 FSH分别刺激KGN细胞3、6、12、24、48、72 h后收集细胞,进行不同时间点的蛋白磷酸化水平差异含量...

                【关键词】 卵泡刺激素转化生长因子β信号通路人卵巢颗粒细胞

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                【中文期刊】 Qianhui Huang  Yu Liu  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2021年19卷2期 267-281页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

                【摘要】 Annotating cell types is a critical step in single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data analysis.Some supervised or semi...

                【关键词】 scRNA-seqCell typeAnnotation

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