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【中文期刊】 吴胜男 蒋环宇  等 《实用临床医药杂志》 2024年28卷1期 48-55页 ISTICCA

【摘要】 目的 基于生物信息学分析溃疡性结肠炎(UC)中具有诊断和治疗潜力的差异表达基因以及潜在的微小RNA(miRNA).方法 采用加权基因共表达网络分析法对GEO数据库中的芯片原始数据进行筛选.获取UC相关差异表达基因进行富集分析.根据关键基因,...

【关键词】 溃疡性结肠炎； 加权基因共表达网络； miRNA-基因调控网络；

【中文期刊】 赵宏群 张一骅  等 《国际免疫学杂志》 2015年38卷5期 409-412页 ISTICCA

【摘要】 目的 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化形成和发展中的作用机理.方法 从GEO数据库中下载一组人类冠状动脉粥样硬化(AS)的单核细胞转录组基因表达谱数据.通过Bicor相关方法分别构建基于正常和疾病样本差异基因共表达网络,用ClusterOne挖掘...

【关键词】 动脉粥样硬化； 巨噬细胞； 共表达网络；

【中文期刊】 黄涛 熊辉岩  等 《植物生理学报》 2024年60卷4期 697-713页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 干旱胁迫是影响作物生长发育的重要环境条件之一,会导致作物减产、品质下降甚至死亡.作为一种重要的麦类作物,大麦具有比水稻和小麦等谷物更好的抗旱性,被认为是分析作物抗旱性的重要模型系统,本研究整合SRA数据库的6个干旱胁迫RNA-Seq数据集包...

【关键词】 大麦； RNA-seq； 旱胁迫；

【中文期刊】 王庭宇 邵联波  等 《中华细胞与干细胞杂志（电子版）》 2024年14卷5期 303-312页 ISTIC

【摘要】 目的筛选Stanford A 型主动脉夹层中的差异表达基因并构建基因共表达网络，以深入解析该疾病的发病机制并筛选潜在的新型分子标志物。方法在GEO数据库获取Stanford A 型主动脉夹层相关的基因表达谱芯片，采用R 语言limma 包筛...

【关键词】 Stanford A 型主动脉夹层； 基因表达谱； KIF20A；

【中文期刊】 韩雪婷 王艳艳  等 《上海医学》 2024年47卷2期 74-82页 ISTICCA

【摘要】 目的 通过生物信息学方法探索射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)潜在的生物标志物和治疗靶点.方法 使用NCBI-GEO数据库检索获得GSE53437高通量测序数据进行分析.通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)获取与HFpEF密切相关的基...

【关键词】 射血分数保留的心力衰竭； 加权基因共表达网络分析； 微RNA；

【中文期刊】 Lu Wang Jinchen Li  等 《遗传学报》 2022年49卷2期 145-154页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Primary biliary cholangitis(PBC)is an autoimmune disease involving dysregulation of a broad array of homeostatic and met...

【关键词】 Primary biliary cholangitis； de novo mutations； Whole exome sequencing；

【外文期刊】 Hou, Mi-Xiao ; Liu, Jin-Xing ; 等 《Current Bioinformatics》 2019年14卷8期 762-770页

【关键词】 Non-negative matrix factorization; weighted gene co-expression network analysis; differentially expressed genes;

【外文期刊】 Anil Kumar Nalini Chandran ; Nikita Bhatnagar ; 等 《Plant Molecular Biology》 2018年96卷1/2期 17-34页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Co-expression network; Meta-analysis of gene expression data; Mutant;

【外文期刊】 Liu, Xiao-Dan ; Xie, Da-Fei ; 等 《International Journal of Radiation Biology: Covering the Physical, Chemical, Biological, and Medical Effects of Ionizing and Non-ionizing Radiations》 2019年95卷1期 144-155页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 lncRNA; mRNA; co-expression network;

【外文期刊】 Z. HU ; D. YANG ; 等 《Oncology letters》 2019年17卷5 Pt.B期 4474-4486页

【关键词】 gastric cancer; long non-coding RNAs; weighed gene co-expression network analysis;