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【中文期刊】 李健晴 刘奇 等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷6期 520-528页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析马尔堡病毒(Marburg virus,MARV)基因组密码子使用偏爱性及其影响因素,为疫苗及特异性抗体的制备提供参考.方法 使用EMBOSS以及Codon W、SPSS 26.0等软件对GenBank数据库中93条MARV编码序...
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【中文期刊】 刘涛 尹登攀 等 《西北林学院学报》 2023年38卷5期 102-109页
【摘要】 为探究南五味子属植物叶绿体基因组密码子的使用偏好性及影响因素,利用 Codon W 1.4.2、CUSP及EMBOSS等程序,进行中性绘图、ENC-plot及PR2-plot绘图分析.结果表明,南五味子属 4 个物种的叶绿体基因组密码子总体...
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【中文期刊】 王其刚 曹世睿 等 《广西植物》 2025年45卷1期 15-30页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 中甸刺玫(Rosa praelucens)是云南香格里拉市的特有"极危"植物和国家二级重点保护植物,也是著名的高山花卉和重要的十倍体月季种质资源,种内存在丰富的表型多样性.为了澄清中甸刺玫种内表型变异的遗传背景,该文利用二代测序技术对40个...
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【中文期刊】 曲荣举 才让扎西 等 《广西植物》 2025年45卷5期 809-823页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为明确西北地区重要药用植物唐古红景天(Rhodiola tangutica)的叶绿体基因组结构特点、基因信息和系统发育关系,该研究利用Illumina NovaSeq6000 对基因组进行了测序,运用GeSeq、PGA、NOVOPlasty...
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【中文期刊】 余米 周梦 等 《中药材》 2025年48卷10期 2458-2462页MEDLINEISTICPKUCA
【摘要】 目的:分析不同水蛭的转录组表达基因密码子的使用模式及影响因素,寻找基因序列与功能蛋白之间可能存在的关联性,为进一步规模化生产水蛭活性蛋白的基因工程实践提供了不可或缺的关键数据和理论指导.方法:采用Perl语言和CondonW1.4.2 等软...
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【中文期刊】 罗远 徐勤彬 等 《中国野生植物资源》 2025年44卷10期 45-52,138页CSCD
【摘要】 目的:确定绒叶含笑叶绿体基因组密码子的使用模式以及其影响因素,为绒叶含笑物种改良及物种保护提供依据.方法:使用CodonW、Genepioneer等软件分析绒叶含笑的密码子偏好性.结果:绒叶含笑叶绿体基因组RSCU>1的密码子有31个,其中...
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【中文期刊】 杨涌 李敏敏 等 《特产研究》 2025年47卷4期 1-11页
【摘要】 为研究豆科药用植物叶绿体基因组特征,为物种鉴定和系统进化发育等研究奠定理论基础.本研究通过利用CodonW、EM-BOSS、MEGA、R 等生物信息学及统计分析软件鉴定叶绿体基因组密码子使用偏好性,利用IRscope、mVISTA、Dna ...
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【中文期刊】 邓永彪 张进 等 《广西植物》 2024年44卷1期 30-42页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 越南小花金花茶(Camellia minima)是一种珍稀濒危的金花茶组植物,目前尚未有其叶绿体基因组的相关研究.该研究利用Illumina HiSeq 2000平台对越南小花金花茶进行了叶绿体基因组序列的测序、组装、注释和分析.结果表明:...
- 概要：
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【中文期刊】 修志莹 赵艳玲 等 《广西植物》 2024年44卷9期 1755-1771页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 牡荆属(Vitex L.)广布于热带和亚热带地区,多为乔木或灌木,包含众多具有药用价值、观赏价值和生态价值的植物.为了解牡荆属的叶绿体基因组特征、系统位置及种间关系,该研究从头组装、注释获得穗花牡荆(V.agnus-castus)的叶绿体基...
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【中文期刊】 周美 王金涛 等 《西北植物学报》 2024年44卷9期 1445-1455页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]分析4种霸王属植物叶绿体基因组密码子的使用模式及其成因,为深入理解霸王属植物的密码子优化、偏好机制研究及遗传进化关系提供科学依据.[方法]用CodonW、EMBOSS等对叶绿体基因组筛选出的40条基因编码序列密码子进行ENC-plo...
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