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【中文期刊】 张静雯 田桂铭 等 《中国食品学报》 2024年24卷3期 221-230页
【摘要】 目的:探究副干酪乳酪杆菌PC-01经高密度发酵后,不同表型菌落的基因组差异.方法:采用第2代测序技术,对高密度发酵的10株具有不同表型特征的副干酪乳酪杆菌PC-01分离株进行全基因组测序,通过比较基因组学方法揭示这10株分离株之间的差异.结...
【关键词】 副干酪乳酪杆菌PC-01; 菌落; 表型;
【中文期刊】 Jian-Yu Jiao Zheng-Han Lian 等 《微生物(英文)》 2022年1卷2期 198-209页
【关键词】 comparative genomics; denitrification; evolutionary history;
【中文期刊】 Jacqueline Rehner Georges Pierre Schmartz 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2022年20卷2期 405-417页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 High-quality DNA extraction is a crucial step in metagenomic studies.Bias by different isolation kits impairs the compar...
【关键词】 Whole-genome analysis; Comparative genomics; Short-read sequencing;
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2015年1期 73-76页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Since the proposal for pangenomic study, there have been a dozen software tools actively in use for pangenomic analysis....
【关键词】 Pangenomics; Pangenome; Comparative analysis;
【中文期刊】 《植物分类学报》 2010年48卷2期 77-93页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 More than 190 plastid genomes have been completely sequenced during the past two decades due to advances in DNA sequenci...
【关键词】 chloroplast phylogenomics; comparative genomics; gene loss;
【中文期刊】 《基因组、蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2007年5卷1期 35-44页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 We have recently cloned a pathogen inducible blast resistance gene Pi-kh from the indica rice line Tetep using a positio...
【关键词】 comparative genomics; blast resistance gene; genome analysis;
【中文期刊】 红梅 冯陈晨 等 《中国人兽共患病学报》 2014年30卷11期 1133-1136页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 为了了解布鲁氏菌S2疫苗株全基因组结构及分子生物学功能.方法 对布鲁氏菌疫苗株S2进行全基因组测序,并与GenBank公布的6株牛羊布鲁氏菌进行比较基因组学研究.结果与结论 通过全基因组测序发现S2基因组大小为3 331 982 bp...
【关键词】 布鲁氏菌; 布鲁氏菌疫S2疫苗株; 全基因组测序;
【中文期刊】 刘娜 郭云波 等 《南方医科大学学报》 2010年30卷2期 219-223页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 开发一个基于Web的本地服务器支持的功能全面的基因组比较和可视化平台,以加快对基因组的分析.方法 构建以Apache HTTP服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言编程,优选整合了MUMmer、LAGAN、Mauve等多个基因组...
【中文期刊】 刘坤 孙文松 等 《微生物学通报》 2024年51卷11期 4667-4686页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [背景]细菌性软腐病是植物根部主要病害之一,可在作物生长期和储藏期造成巨大损失.2023 年本团队首次发现并报道了由Pseudomonas glycinae引起的人参细菌性软腐病.[目的]探索Pseudomonas glycinae XJF...