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【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2012年10卷2期 58-73页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 In the realm of bioinformatics and computational biology,the most rudimentary data upon which all the analysis is built ...
【关键词】 Genome assembly; Next-generation sequencing; Comparative assembly;
【中文期刊】 《定量生物学(英文版)》 2019年7卷4期 278-292页
【摘要】 Background:De novo genome assembly relies on two kinds of graphs:de Bruijn graphs and overlap graphs.Overlap graphs are ...
【外文期刊】 Pan, Tony ; Nihalani, Rahul ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2020年17卷1期 136-148页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Si, Xiuhua ; Wang, Qian ; 等 《Bioengineered》 2017年8卷6期 750-758页
【关键词】 De Bruijn graph; gene splicing; Hadoop;
【外文期刊】 Medvedev, P ; Brudno, M ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2009年16卷8期 1101-1116页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Bonissone, Stefano R. ; Pevzner, Pavel A. ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2016年23卷6期 483-494页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 antibody repertoire analysis; immunoglobulin classification; de Bruijn graph;
【外文期刊】 Hormozdiari, Farhad ; Eskin, Eleazar ; 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2015年13卷2期 MEDLINE
【关键词】 Genome assembly; De Bruijn graph; high-throughput sequencing;
【外文期刊】 Theiler James ; Korber Bette ; 《Statistics in medicine》 2018年37卷2期 181-194页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Bilal Wajid ; Erchin Serpedin ; 等 《International journal of computational biology and drug design》 2015年8卷3期 226-250页
【关键词】 next generation sequencing; genome assembly; reference assisted assembly;
【外文期刊】 Mingzhu Sun ; Erli Pang ; 等 《Molecular ecology resources》 2023年23卷2期 499-510页
【关键词】 de Bruijn graph; ploidy estimation; polyploidy;