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                【中文期刊】 彭荣俞  蒋析文  《分子诊断与治疗杂志》 2025年17卷3期 585-588页ISTIC

                【摘要】 作为自然界的生物催化剂,酶能够催化广泛的化学转化,不仅反应条件温和,而且活性和选择性高.然而,天然酶对非天然物质的催化活性或其对映体选择性的不足均限制了它们的工业应用,通过酶的定向改造可提高酶的催化活性和稳定性,同时提高可识别的底物范围.本...

                【关键词】 生物催化定向改造

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                【中文期刊】 周佳楠  杨立荣  等 《生物加工过程》 2025年23卷6期 628-638页ISTICCABP

                【摘要】 机器学习作为辅助酶工程的重要工具,能够挖掘生物序列与功能之间的复杂关系,加速高性能酶的筛选与设计,但因机器学习模型的卓越性能需要大量高质量标注数据作为支撑,使得湿实验获取数据面临巨大挑战.近年来,小样本机器学习通过引入迁移学习等策略突破数据...

                【关键词】 小样本学习机器学习酶工程

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                【中文期刊】 宋成治  林一瀚  《合成生物学》 2025年6卷3期 617-635页

                【摘要】 定向进化是合成生物学领域的核心底层技术之一.通过在实验室中模拟自然界发生的进化过程,定向进化利用功能筛选从大量的突变序列文库中不断获得性能提升的蛋白序列,帮助实现野生型蛋白难以实现的功能.近年来不断发展的机器学习、蛋白语言模型等人工智能(a...

                【关键词】 定向进化机器学习蛋白改造

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                【中文期刊】 章益蜻  刘高雯  《合成生物学》 2025年6卷3期 685-700页

                【摘要】 合成生物学作为一门通过设计、构建和改造生物系统来实现其特定功能的学科,被广泛应用于生物制造、环境保护和药物合成等领域.基因功能的系统性探索和工程菌株文库的构建是推动合成生物学发展的重要手段.本文重点介绍了不同酵母文库在合成生物学中的构建方法...

                【关键词】 酵母文库功能基因组学

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                【中文期刊】 彭华康  张焕芝  等 《食品科学》 2025年46卷10期 378-386页

                【摘要】 食品安全关乎消费者身体健康.酶型时间-温度指示器可监测食品生产后的全程热积累量并产生直观的颜色变化以指示食品货架期,但酶的热稳定性限制了其推广和应用.酶工程可通过固定化、定向进化及理性设计等策略提高酶的热稳定性.近年来,机器学习等人工智能方...

                【关键词】 酶型时间-温度指示器酶工程定向进化

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                【中文期刊】 王明鹏  陈蕾  等 《合成生物学》 2025年6卷4期 728-763页

                【摘要】 有机卤化物在医药和农业领域应用广泛,但其化学合成过程污染严重.卤化酶是实现化合物卤素修饰及功能改善的重要工具.与化学合成不同,卤化酶可以实现有机结构特定位置的精准卤化,并且反应条件温和,避免了苛刻反应条件以及有毒试剂的使用,其催化反应的过程...

                【关键词】 卤化酶生物合成有机卤化物

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                【中文期刊】 Jinghao Shi  Bo Yuan  等 《生物设计研究(英文)》 2025年7卷1期 46-57页

                【摘要】 Stability is a crucial factor influencing applicability of industrial biocatalysts,and enzymatic operations in partial o...

                【关键词】 ThermostabilityBiocatalysisProtein engineering

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                【中文期刊】 周玉洁  易啸  《合成生物学》 2025年6卷6期 1421-1434页

                【摘要】 在合成生物学中,转录因子作为遗传开关,可通过模块化组合策略构建复杂的调控网络.现有工程化的基因元件种类有限,因此建立高效的遗传开关定向进化平台对于基因线路设计和代谢通路优化具有重要价值.本研究整合TADR活细胞定向进化系统和基于半乳糖磷酸激...

                【关键词】 活细胞定向进化正负筛选遗传开关

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                【中文期刊】 侯超  张申平  等 《生物加工过程》 2024年22卷1期 81-88页ISTICCABP

                【摘要】 乳糖酶是一种重要的生物催化剂,基于其水解和转糖苷功能,能水解乳糖和生产低聚半乳糖.在乳糖酶的实际应用中,受复杂反应体系和反应条件(不适宜的酸碱度、高温和有机溶剂)的影响,乳糖酶的稳定性和酶活性较差,制约了乳糖酶的应用.因此,开发适应工业应用...

                【关键词】 特异性乳糖酶催化机制高产菌株

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