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            1. The structure of the Alzheimer amyloid beta 10-35 peptide probed through replica-exchange molecular dynamics simulations in explicit solvent

            【外文期刊】 Baumketner A ; Shea JE ; 《Journal of Molecular Biology》 2007年366卷1期 275-285页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 alzheimer amyloid beta peptide; replica exhange molecular dynamics simulations; peptide conformations;

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            2. Why Argonaute is needed to make microRNA target search fast and reliable

            【外文期刊】 Klein, Misha ; Chandradoss, Stanley D. ; 等 《Seminars in cell and developmental biology》 2017年65卷 20-28页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Argonaute; miRNA; Target Search;

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            3. Free energy landscapes of peptides by enhanced conformational sampling

            【外文期刊】 Nakajima N. ; Kidera A. ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2000年296卷1期 197-216页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Beta-turns; Free energy landscape; Hydration energy;

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            4. Folding and aggregation kinetics of a beta-hairpin

            【外文期刊】 Munoz V ; Ghirlando R ; 等 《Biochemistry》 2006年45卷23期 7023-7035页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; FREE-ENERGY LANDSCAPE; INTRAMOLECULAR CONTACT FORMATION;

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            5. Protein dynamics and molecular motions study in relation to molecular interaction between proteins from sulfur oxidizing proteobacteria Allochromatium vinosum

            【外文期刊】 Ghosh, Semanti ; Bagchi, Angshuman ; 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2021年39卷7/8期 2771-2787页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Reverse dissimilatory sulfite reductase; sulfur oxidation mechanism; structure-dynamics-function relationship;

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            6. Molecular insights into the mechanisms of cation-type specific stability and denaturation of poly-l-glutamate: A simulation study

            【外文期刊】 Shen, H. ; Shen, X. ; 等 《Molecular simulation》 2013年39卷10/13期 842-847页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 cations; conformation changes; free-energy landscape;

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            7. An account on the factors determining the extra stability of the beta-hairpin from B1 domain of protein G

            【外文期刊】 Govind, Gokul ; Nayana, E. C. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2022年40卷23期 12841-12847页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Molecular dynamics; protein folding; hydrophobic interactions;

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            8. A comparative study of structural and conformational properties of WNK kinase isoforms bound to an inhibitor: insights from molecular dynamic simulations

            【外文期刊】 Nisha Amarnath,Jonniya ; Md Fulbabu,Sk ; 等 2022年40卷3/4期 1400-1415页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 With-no-lysine (WNK) kinase; conformational dynamics; molecular dynamics;

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            9. Exploring the interactional details between aldose reductase (AKR1B1) and 3-Mercapto-5H-1,2,4-triazino[5,6-b]indole-5-acetic acid through molecular dynamics simulations

            【外文期刊】 Zhan ; J.-Y. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2019年37卷7/8期 1724-1735页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 AKR1B1; Aldose Reductase; aldose reductase;

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            10. Salt effects on hydrophobic-core formation in folding of a helical miniprotein studied by molecular dynamics simulations

            【外文期刊】 Yoda,T. ; Sugita,Y. ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2014年82卷6期 933-943页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Free-energy landscape; Multicanonical replica-exchange method; Protein folding;

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