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【中文期刊】 Yi-Heng Zhu Chengxin Zhang  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷5期 1013-1027页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Gene Ontology(GO)has been widely used to annotate functions of genes and gene prod-ucts.Here,we proposed a new method,Tr...

【关键词】 Gene function annotation； Gene Ontology； Transcript expression profile；

【中文期刊】 Hui Wan Liang Chen  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷5期 939-958页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Current cell-type annotation tools for single-cell RNA sequencing(scRNA-seq)data mainly utilize well-annotated source da...

【关键词】 Cell-type annotation； Transfer learning； Privacy preservation；

【中文期刊】 吴赛 王闪闪  等 《昆虫学报》 2025年68卷1期 1-13页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]航天蚕Bombyx mori后代小茧突变体sc的幼虫发育缓慢,食桑量少,推测其生长发育相关通路基因受到基因突变的影响.前期研究表明,sc突变受一对位于家蚕第3连锁群的隐性基因控制,但其控制基因并未被鉴定.本研究拟通过比较分析sc与航...

【关键词】 家蚕； 航天蚕； 小茧突变体；

【中文期刊】 刘辉 季海峰  等 《中国畜牧兽医》 2025年52卷1期 25-38页

【摘要】 [目的]旨在对1株具有较强耐酸耐胆盐特性的猪源动物联合乳杆菌S7进行全基因组测序及生物信息学分析.[方法]结合三代PacBio RS Ⅱ和二代Illumina HiSeq 2000测序技术对动物联合乳杆菌S7进行了全基因组测序,在此基础上使...

【关键词】 猪； 动物联合乳杆菌； 全基因组测序；

【中文期刊】 张极峰 白晓轩  等 《生物学杂志》 2024年41卷5期 20-25页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 为充分解析草酸青霉SG-4的遗传信息,利用二代Illumina测序和三代PacBio测序相结合的方法对SG-4的全基因组进行测序,经过基因组组装、基因预测和功能注释后,对全基因组进行共线性分析和次级代谢产物合成基因簇预测.结果表明,草酸青霉...

【关键词】 草酸青霉； SG-4； 基因组；

【中文期刊】 李梦鸽 张晨源  等 《山西医科大学学报》 2024年55卷6期 740-745页 ISTICCA

【摘要】 目的 筛选术后咽痛(postoperative sore throat,POST)病理过程中的差异表达的蛋白质,探讨POST的发生机制.方法 收集山西医科大学第一医院择期手术行全身麻醉气管插管患者的咽部分泌物20例,根据其术后24 h是否发...

【关键词】 术后咽痛； 蛋白质组学； Wnt信号通路；

【中文期刊】 卢丽颖 郑景辉  等 《西部中医药》 2024年37卷3期 60-66页 ISTIC

【摘要】 目的:探讨水蛭治疗心 肌梗死(myocardial infarction,MI)的差异靶基因和信号通路.方法:从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中检索与MI有关的数据芯片,利用GEO2R工具对数据...

【关键词】 心肌梗死； 水蛭； 差异基因；

【中文期刊】 阎思宇 谭杰骏  等 《医学新知》 2024年34卷11期 1276-1283页 ISTICCA

【摘要】 目的 探索搭建真实世界数据标注平台,并比较检索增强生成式技术(retrieval augmented generation,RAG)结合大语言模型,及预训练语言模型的预训练-微调方法的真实世界数据提取效果.方法 以真实世界电子病历数据中的膀...

【关键词】 真实世界数据； 电子病历； 标注平台；

【中文期刊】 张铭露 温苗  等 《药学前沿》 2024年28卷12期 663-670页 ISTICCA

【摘要】 目的 利用抗体芯片技术考察卵泡刺激素(FSH)在不同时间上对卵巢颗粒细胞(KGN)转化生长因子β(TGF-β)信号通路的影响.方法 FSH分别刺激KGN细胞3、6、12、24、48、72 h后收集细胞,进行不同时间点的蛋白磷酸化水平差异含量...

【关键词】 卵泡刺激素； 转化生长因子β信号通路； 人卵巢颗粒细胞；

【中文期刊】 白丽君 兰箐松  等 《中国食品学报》 2024年24卷10期 37-46页

【摘要】 为解析芽胞杆菌四甲基吡嗪(TTMP)生物合成途径,对筛选自高盐稀态酱醪的贝莱斯芽胞杆菌CS1.13全基因组进行注释,结合固态发酵研究其TTMP的生物合成途径及调控特征,结果显示:COG、GO及碳水化合物活性酶注释发现CS1.13参与氨基酸代...

【关键词】 贝莱斯芽胞杆菌； 四甲基吡嗪； 基因注释；