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【中文期刊】 Yi-Heng Zhu Chengxin Zhang  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷5期 1013-1027页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Gene Ontology(GO)has been widely used to annotate functions of genes and gene prod-ucts.Here,we proposed a new method,Tr...

【关键词】 Gene function annotation； Gene Ontology； Transcript expression profile；

【中文期刊】 马浩天 李杨  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷12期 5117-5127页

【摘要】 [目的]贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)CM7-4是从海水中分离的具有良好抗菌活性的芽孢杆菌.本试验旨在探究贝莱斯芽孢杆菌CM7-4的抗菌机理,并对其全基因组序列进行分析,以期挖掘其抗菌等功能特性基因.[方法]通过酸...

【关键词】 芽孢杆菌； 全基因组测序； 细菌素；

【中文期刊】 罗婷 韩著  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷5期 2154-2167页

【摘要】 旨在进一步完善牛支原体全基因组数据库,阐明其生物学功能和遗传进化关系,对西藏牦牛源牛支原体T10株进行了全基因组测序及其序列分析.使用Nanopore和Illumina PE150测序平台对T10株进行全基因组序列测定,利用生物信息学对其进...

【关键词】 牦牛； 牛支原体； 全基因组测序；

【中文期刊】 刘雄盛 尹国平  等 《广西植物》 2023年43卷9期 1710-1720页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 枫香因其树形优美,入秋后叶色红艳或橙黄,极具观赏价值,是优良的景观生态树种.为了解枫香叶片变色及其次级代谢过程的遗传基础,该文以枫香 5 个叶片变色期叶片混合样品为材料,利用单分子实时测序技术(PacBio平台)对其进行全长转录组测序.结果...

【关键词】 枫香； 叶片变色期； 单分子实时测序技术；

【中文期刊】 张龙 蔡时可  等 《广州中医药大学学报》 2023年40卷8期 2042-2048页 ISTICCA

【摘要】 [目的]获取独脚金[Striga asiatica(L.)O.Kuntze.]的转录组信息特征.[方法]提取独脚金叶片和茎的总RNA、建库、测序、组装,以注释和比对等生物信息分析技术得到独脚金转录组的遗传信息.[结果]共获得38 096 4...

【关键词】 独脚金； 转录组； Unigenes；

【中文期刊】 郑雪 梁琪  等 《食品科学》 2023年44卷20期 119-126页

【摘要】 融合魏斯氏菌(Weissella confusa)ZW2 1是1 株具有良好抗菌活性的牦牛乳源乳酸菌,为探索其抗菌机理,分析其全基因组序列并挖掘该菌株的抗菌等功能特性基因.本研究基于Illumina NovaSeq PE150平台对W.co...

【关键词】 牦牛乳； 融合魏斯氏菌； 全基因组测序；

【中文期刊】 蒲思成 郑惠滨  等 《中国畜牧兽医》 2023年50卷11期 4545-4556页

【摘要】 [目的]本研究旨在通过研究1株牦牛源产细菌素屎肠球菌SWUN5732的基因组序列,发掘该菌种的关键功能性特征基因.[方法]通过Illumina PE150测序系统,对屎肠球菌SWUN5732进行基因组测序,并在GO、KEGG、COG和NR数...

【关键词】 牦牛酸奶； 屎肠球菌； 基因测序；

【中文期刊】 许婷婷 司静  等 《食品研究与开发》 2023年44卷18期 185-192页

【摘要】 长双歧杆菌由于其具有的益生功能而备受关注,该文旨在基于全基因组分析,揭示长双歧杆菌W13(Bifi-dobacterium longum W13)的基因特性,分析其功能基因和代谢通路.结果表明,长双歧杆菌W13隶属于长亚种,通过直系同源蛋白...

【关键词】 益生菌； 长双歧杆菌； 基因组；

【中文期刊】 《仿生工程学报（英文版）》 2007年4卷3期 177-184页 SCIMEDLINEISTICCSCD

【摘要】 It is very important in the field of bioinformatics to apply computer to perform the function annotation for new sequenc...

【关键词】 gene function； annotation； variable precision rough set；

【中文期刊】 徐福意 晁天柱  等 《中国实验动物学报》 2017年25卷1期 20-24页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 基于野生小家鼠来源1号染色体替换系群体(population of specific chromosome 1 substitu-tion strains,PCSSs)中18个品系的全基因组重测序结果,鉴定1号染色体上的缺失突变并对其...

【关键词】 缺失突变鉴定； 二代测序； 功能注释；