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【中文期刊】 陈文杰 肖钧  等 《生命科学研究》 2023年27卷5期 435-446页 ISTICCA

【摘要】 为筛选骨关节炎(osteoarthritis,OA)免疫浸润相关基因,从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中获取多个芯片数据,分为训练集以及验证集,筛选出差异表达基因(differentially ex...

【关键词】 生物信息学； 骨关节炎(OA)； 基因集富集分析(GSEA)；

【中文期刊】 王建平 霍子天  等 《生命科学研究》 2024年28卷2期 143-151页 ISTICCA

【摘要】 免疫细胞一直被认为是维持机体平衡的重要调节因子,对肿瘤浸润免疫细胞进行量化分析有望揭示免疫系统在肿瘤中的多方面作用.本文总结了量化肿瘤浸润免疫细胞的计算方法及相关的分析工具,包括基于标志基因富集分析方法和反卷积分析方法开发的算法模型与工具,...

【关键词】 肿瘤； 肿瘤浸润免疫细胞(TIC)； 基因集富集分析(GSEA)；

【中文期刊】 尹晓红 刘小平  等 《现代泌尿外科杂志》 2017年22卷11期 818-822页 ISTICCA

【摘要】 目的 探讨TAGLN基因在膀胱癌患者中的表达情况及与临床病理特征的关系,评价其对膀胱癌患者临床预后的影响.方法 检索并下载GEO膀胱癌基因表达数据集,分析膀胱癌患者基因表达谱数据及临床信息,明确TAGLN基因对膀胱癌患者预后的影响,并通过基...

【关键词】 TAGLN基因； 膀胱癌； 临床预后；

【外文期刊】 Mohammed I. Khan ; Konrad J. Debski ; 等 《American Journal of Physiology》 2016年311卷2 Pt.2期 F424-F436页 SCIEMEDLINE

【关键词】 metastatic renal cell carcinoma; Gene Set Enrichment Analysis (GSEA); ingenuity pathway analysis (IPA);

【外文期刊】 Jui-Hung Hung ; Tun-Hsiang Yang ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2012年13卷3期 281-291页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 CMC; Controlled mutual coverage; Expression analysis;

【外文期刊】 Fang, Sheng ; Zhong, Lin ; 等 《Molecular Neurobiology》 2021年58卷6期 2643-2662页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Spinal cord injury (SCI); Gene Ontology's (GO's) enrichment analysis; Kyoto Encyclopedia ofGenes and Genomes pathway (KEGG);

【外文期刊】 Liu, Yong ; Jin, Mingwei ; 等 2020年78卷3期 301-308页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Nrdp1 (neuregulin receptor degradation protein-1); Glioma; GSEA (gene set enrichment analysis);

【外文期刊】 Jeganathan,Manivannan ; Lakshmikirupa,Sundaresan ; 《Gene reports》 2021年25卷 101312页

【关键词】 ACE2, angiotensin-converting enzyme 2; COVID-19; COVID19, coronavirus disease 2019;

【外文期刊】 Xiangxiong,Huang ; Heyang,Xu ; 等 《Journal of gastrointestinal oncology》 2021年12卷6期 2749-2762页 SCIMEDLINE

【关键词】 Colon cancer (CC); gene set enrichment analysis (GSEA); gene signature;

【外文期刊】 Markus M,Luedi ; Sanjay K,Singh ; 等 《Journal of neurosurgery》 2018年129卷6期 1446-1455页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 APC = allophycocyanin; FACS = fluorescence-activated cell sorting; FDR = false discovery rate;