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【中文期刊】 高振 熊强  等 《化工进展》 2013年7期 1625-1628页

【摘要】 代谢通量分析可以有效预测微生物的代谢状况，指导生物合成过程，已在多个领域得到成功应用。本文概括分析了三大代谢通量分析技术（基于物料平衡、基于同位素示踪技术以及基于基因组尺度规模网络）在工业生物技术领域的应用，阐述了相关技术的优势及局限性。在...

【关键词】 代谢通量分析； 物料平衡； 同位素示踪；

【中文期刊】 郑媛嘉 许燕玲  等 《中药新药与临床药理》 2016年27卷4期 578-583页 ISTICPKUCSCDCA

【关键词】 基因组规模； 代谢网络； 中医证候；

【中文期刊】 李培顺 马红武  等 《生物工程学报》 2016年32卷1期 1-13页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 高产特定产品的人工细胞工厂的构建需要对野生菌株进行大量的基因工程改造,近年来随着大量基因组尺度代谢网络模型的构建,人们提出了多种基于代谢网络分析预测基因改造靶点以使某一目标化合物合成最优的方法.这些方法利用基因组尺度代谢网络模型中的反应计量...

【关键词】 基因组尺度； 代谢网络； 菌种优化；

【中文期刊】 隋雨菲 欧阳立明  等 《生物工程学报》 2016年32卷8期 1010-1025页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 黑曲霉作为重要的工业发酵菌株,被广泛用于多种有机酸和工业用酶的生产.随着组学技术的日益发展和成熟,黑曲霉的基因组、转录组、蛋白质组、代谢组等组学数据不断增长,宣告着黑曲霉生物过程研究大数据时代的到来.从单一组学的数据分析、多组学的比较到以基...

【关键词】 黑曲霉； 基因组； 转录组；

【中文期刊】 刘秀梅 刘占英  等 《基因组学与应用生物学》 2016年35卷3期 635-639页 ISTICPKUCSCDCA

【关键词】 基因尺度代谢网络模型； 生物质燃料产生菌； 菌种改造；

【中文期刊】 万方 张斌  等 《中国生物工程杂志》 2015年35卷8期 51-58页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 为了选育精氨酸高产菌株,基于谷氨酸棒杆菌的基因组尺度代谢网络模型的指导,以钝齿棒杆菌(Corynebacterium crenatum)MT-M4为出发菌株,通过基因敲除技术构建了proC和putP敲除菌株.摇瓶发酵结果表明,proC敲除菌...

【关键词】 钝齿棒杆菌； 精氨酸； 基因组尺度代谢网络模型；

【中文期刊】 简星星 高琪  等 《微生物学通报》 2015年42卷9期 1752-1761页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 [目的]近十年来,基因组代谢网络模型迅速发展.通过构建基因组代谢网络模型进行计算机仿真模拟已成为研究生物体复杂的生理代谢不可或缺的工具.实现对仿真结果的可视化分析,可以直观地追踪模型中的代谢流向,从而更好地对仿真结果进行分析.[方法]在简要...

【关键词】 基因组规模代谢网络模型； 解脂耶氏酵母； 可视化；

【中文期刊】 万方 张斌  等 《中国生物工程杂志》 2015年35卷9期 28-34页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 旁支代谢途径的截断有利于目的氨基酸合成途径的集流.基于基因组尺度代谢网络模型的预测,以钝齿棒杆菌(Corynebacterium crenatum)MT-M4为出发菌株,通过无痕敲除技术分别敲除了编码磷酸乙酰基转移酶的pta基因及编码乙酸激...

【关键词】 钝齿棒杆菌； 精氨酸； 无痕敲除技术；

【中文期刊】 张斌 陈进聪  等 《中国生物工程杂志》 2014年34卷4期 127-132页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 L-精氨酸是一种非常重要的半必需氨基酸,其作为生物体生成NO的前体,参与尿素循环,对人和动物均具有重要的生理功能.现阶段生产精氨酸的主流方法是微生物发酵法,因此,如何快速、高效地选育精氨酸高产菌种成为业内关注的焦点.主要对精氨酸产生菌分子育...

【关键词】 L-精氨酸； 分子育种； 代谢工程；

【中文期刊】 汤彬彩 郝彤  等 《生物工程学报》 2013年29卷8期 1173-1184页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 最小生命体的合成是合成生物学研究的重要方向.最小化基因组的同时而又不对细胞生长产生影响是代谢工程研究的一个重要目标.文中提出了一种从基因组尺度代谢网络模型出发,通过零通量反应删除及对非必需基因组合删除计算获得基因组最小化代谢网络模型的方法,...

【关键词】 基因组尺度代谢网络； 基因组最小化； 组合算法；