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【中文期刊】 高姗 宋鑫伟 等 《生物信息学》 2025年23卷2期 152-164页ISTIC
【摘要】 前期相关研究表明,第一内含子与其它内含子之间的相互作用关系可能与基因表达调控密切有关.为探索最末内含子与其他内含子之间是否同样存在着相互作用?以线粒体核糖体蛋白基因序列为样本,计算每个基因序列的最末内含子与其他内含子反向互补序列之间的最佳匹...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《浙大学报（英文版）（B辑：生物医学和生物技术）》 2009年10卷11期 847-851页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 We examined salt tolerance responsive genes in Pak-choi under salt stress and analyze their potential function. The mRNA...
【关键词】 Brassica campestris L. ssp. chinensis (L.) Makino var. communis Tsen et Lee；Salinity tolerance；Gene differential expression；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张林 《生物信息学》 2014年3期 179-184页ISTIC
【摘要】 为探索准确、高效、低成本、通用性并存的生物序列局部比对方法。将点阵图算法、启发式算法等各种序列局部比对算法中准确性最高的动态规划局部比对算法在计算机中实现，并通过流式模型将其映射到图形硬件上以实现算法加速，再通过实例比对搜索数据库完成比对时...
【关键词】 生物分子；序列局部比对；动态规划局部比对算法；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张强 李宏 等 《生物信息学》 2013年11卷3期 172-180页ISTIC
【摘要】 剪接后的内含子与相应mRNA序列的相互作用在基因表达调控过程中起着非常重要的作用.基于27个物种的核糖核蛋白基因序列,采用Smith-Waterman局域比对方法得到外显子连接序列与相应内含子序列的最佳匹配片段,分析了外显子连接序列上的匹配...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 薛卫 王雄飞 等 《生物工程学报》 2017年33卷4期 683-691页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 基于Adaboost算法对多个相似性比对K最近邻(K-nearest neighbor,KNN)分类器集成实现蛋白质的亚细胞定位预测.相似性比对KNN算法分别以氨基酸组成、二肽、伪氨基酸组成为蛋白序列特征,在KNN的决策阶段使用Blast比...
【关键词】 亚细胞区间；蛋白序列特征；K-nearest neighbor；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Hernandez P. ; Dorado G. ; 等 《DNA Sequence: The Journal of DNA Sequencing and Mapping》 2000年11卷3/4期 339-347页SCIMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Yang, Wen ; Wang, Lusheng ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2021年28卷8期 789-803页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 long-read mapping and long-read local alignment;longest common subsequence with distance constraints;k-mer-based local alignment with variable value of k;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Suresh, V. ; Ganesan, K. ; 等 《Protein and peptide letters》 2013年20卷3期 249-254页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Local protein structure;Pairwise local alignment;Protein block;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Athanasios, Alexiou ; Charalampos, Vairaktarakis ; 等 《Current drug metabolism》 2017年18卷1期 5-10页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Drug discovery;global network alignment;local network alignment;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 《Bioinformatics》 2010年26卷8期 1015-1021页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 multiple sequence alignment;consistency problem;pairwise local sequence similarity;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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