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【中文期刊】 崔韶丽 张维佳  等 《高等学校化学学报》 2022年43卷3期 168-174页

【摘要】 采用分子动力学模拟和自由能计算研究了中等活性黑麦草抗冻蛋白(Lolium perenne antifreeze protein,LpAFP)冰结合位点(Ice-binding site,IBS)上苏氨酸(Thr)含量对其吸附冰晶能力的影响....

【关键词】 抗冻蛋白； 自由能计算； 冰晶；

【学位论文】 作者： 徐真昊 导师：赵一雷  上海交通大学  生物医学工程 生物医学工程（硕士） 2013年

【摘要】 复杂体系(如生物体系)的化学反应分子机理一直是实验科学与理论研究的难点与重点.由于反应发生过程的瞬时性,在实验上难以捕捉反应过程中能量较高(观察几率较低)的反应中间体;在计算研究中,现有的计算机能力还难以对复杂体系进行全维度势能面进行电子结...

【关键词】 反应机理； 过渡态；

【学位论文】 作者： 梁娟 导师：赵一雷  上海交通大学  生物医学工程 生物医学工程（硕士） 2011年

【摘要】 蛋白质巯基亚硝基化(S-nitrosylation)是指一氧化氮(NO·)共价结合到蛋白质半胱氨酸残基的过程,它是一种典型的氧化还原依赖的蛋白质翻译后修饰,在介导一氧化氮细胞信号转导中发挥重要作用,且被越来越多的研究证明与疾病和健康密切相关...

【关键词】 S-nitrosylation； CPMD；

【外文期刊】 Sakai, Yuri ; Kawaguchi, Atsushi ; 等 《Microbiology and Immunology》 2018年62卷1期 34-43页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 antivirus drug; influenza virus; M2;

【外文期刊】 Seckfort, Danielle ; Montgomery Pettitt, B. ; 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2019年110卷1期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 disorder to order transition; disordered proteins; LacI;

【外文期刊】 Seckfort, Danielle ; Lynch, Gillian C. ; 等 《Biochimica et Biophysica Acta. General Subjects》 2020年1864卷4期 SCISCIE

【关键词】 Protein; LacI; Disordered proteins;

【外文期刊】 Godfred O.Sabbih ; Kalani M.Wijesinghe ; 等 《Biotechnology Journal: Healthcare,Nutrition,Technology》 2023年18卷12期 MEDLINE

【关键词】 aptamers; IsdA protein; metadynamics;

【外文期刊】 Bai,Q. ; Shen,Y. ; 等 《Biochimica et Biophysica Acta. General Subjects》 2014年1840卷7期 2128-2138页 SCISCIE

【关键词】 Free energy calculation; GPCR; Metadynamics;

【外文期刊】 Sandra J. Moore ; Evelyne Deplazes ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2023年91卷3期 338-353页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 intrinsically disordered proteins; islet amyloid polypeptide; metadynamics;

【外文期刊】 Shadrack, Daniel M. ; Deogratias, Geradius ; 等 《Molecular human reproduction.》 2021年27卷8期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 COVID-19; Docking; Luteolin;