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【中文期刊】 薛健 车长金 《北华大学学报(自然科学版)》 2017年18卷6期 732-734页 ISTICCA
【摘要】 由于宏基因组学的迅猛发展,导致可测序的宏基因组数量激增,可测DNA序列也在扩大,但绝大部分DNA序列种属未知,故生物信息学面临的重要课题是研究一种如何针对这些巨大量宏基因组DNA信息属性约简并正确分类的方法.提出采用RandWPSO结合
【中文期刊】 王慧 鞠峰 《微生物学通报》 2024年51卷6期 1814-1833页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 自2005年罗氏公司推出首台商业化第二代DNA测序仪,基于高通量测序的宏基因组学方法被广泛用于各种环境中微生物群落的组成和功能分析,揭示了环境微生物组中蕴藏着的大量未被发现的新物种、新基因、酶和代谢过程.该系列工作表明了未培养微生物在驱动
【中文期刊】 Konstantinos T.Konstantinidis 《微生物(英文)》 2023年2卷4期 341-349页
【摘要】 Whether prokaryotes,and other microorganisms,form distinct clusters that can be recognized as species remains an issue
【关键词】 average nucleotide identity(ANI); genomovar; homologous recombination;
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2016年14卷6期 371-378页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Microbes are ubiquitously distributed in nature, and recent culture-independent studies have highlighted the
【关键词】 Metagenomic DNA extraction; Gut microbiome; Human feces;
【中文期刊】 黄林生 严雪冰 等 《中华临床营养杂志》 2018年26卷4期 228-234页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析合生元在治疗慢性功能性便秘过程中对肠道菌群的改善情况.方法 根据纳入和排除标准,选取6例慢性功能性便秘患者,留取新鲜粪便,在经过合生元持续治疗1个月后,再次留取粪便.同时选取6名健康志愿者的粪便作为对照组,粪便样本送至实验室并
【中文期刊】 周梦兰 徐英春 等 《中华检验医学杂志》 2016年39卷4期 319-321页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 全基因组测序技术的问世,为基因组研究带来了极大便利,目前已应用于解决许多微生物方面的问题。本文对微生物全基因组测序技术进行了简要概述,主要从病原微生物的发现和培养诊断、病原体特性的快速鉴定、疫情暴发监测及流行病学溯源、疫苗开发及变异监测、
【中文期刊】 毕玉晶 杨瑞馥 《中华炎性肠病杂志(中英文)》 2019年3卷3期 189-193页
【摘要】 肠道微生物群是定居在宿主消化道内的肠道微生物的总称.研究表明,许多疾病都与肠道菌群的改变密切相关.在复杂生态系统中使用高通量测序技术,即16S rRNA测序及元基因组测序,极大地丰富了肠道微生物组数据库,也鉴定出了很多细菌新种,促进了
【中文期刊】 冯晓远 Venki Perumal 等 《微生物学通报》 2018年45卷1期 11-18页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [背景]海洋沉积物中蕴含着丰富的微生物资源,估算约2.9× 1029个细胞,与海水中的微生物总量相当.但是由于缺少可培养物,大部分的微生物缺乏生理特征、代谢方式以及生态功能的相关研究.深古菌(Bathyarchaeota)是一类典型的未
【外文期刊】 Dawid,Dąbkowski ; Paweł,Tabaszewski ; 等 《Journal of bioinformatics and computational biology》 2018年16卷5期 1840021页 SCIMEDLINEBP
【关键词】 Deep coalescence; gene tree; metagenomics;
【外文期刊】 Peter,Simmonds ; 《The Journal of general virology》 2018年99卷3期 277-287页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 classification; concepts; metagenomics;