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【中文期刊】 Xingang Liu Hao Yang 等 《药物分析学报（英文版）》 2025年15卷8期 1860-1872页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Increasing evidence showed that histone deacetylase 6(HDAC6)dysfunction is directly associated with the onset and progre...
【关键词】 Artificial intelligence；Virtual screening；Compound-protein interaction；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郑博恺 罗施中 《中国科技论文在线》 2011年06卷12期 921-925页
【摘要】 近年来分子动力学模拟成为了研究膜蛋白的结构动力学性质的新方法，粗粒化动力学模拟克服了传统全原子动力学模拟遇到的困难，其通过适当的简化全原子模型，降低了模拟的计算量，减少了体系的自由度，提高了计算效率。可以用来研究更长时间跨度和更大体积的膜蛋...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 楼文珠 黄帅帅 等 《浙江临床医学》 2026年28卷1期 32-37页ISTIC
【摘要】 目的 应用网络药理学、转录组学及计算模拟技术探究银杏叶抗慢性心力衰竭的作用机制.方法 通过TCMSP数据库、SwissTargetPrediction数据库进行银杏叶的主要活性成分筛选及靶点预测;通过GeneCards、OMIM、TTD、D...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 雷定伟 顾睿初 等 《遗传》 2025年47卷8期 903-927页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 N6-甲基腺嘌呤(m6A)修饰是真核生物mRNA中最丰富的修饰形式,对mRNA的剪接、加工、降解和翻译的调控具有关键作用.本文介绍了计算方法在m6A修饰研究中的应用,主要有数据驱动的方法预测m6A位点以及基于分子动力学方法探究m6A相关生物...
【关键词】 N6-甲基腺嘌呤修饰；修饰检测方法；修饰位点预测；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘璐 杨志钧 等 《工业微生物》 2025年55卷4期 33-37,51页ISTICCA
【摘要】 酶的理性设计主要围绕活性中心周边展开,但近年来,其研究已逐渐延伸至其他外围残基甚至远端残基领域.酶结构中的通道可连接外界溶剂和酶的活性中心,对酶的催化活性、底物特异性、立体选择性等参数具有重要影响.因此,组成通道的周边氨基酸已成为理性设计的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 马兰英 王彤 等 《山东中医杂志》 2025年44卷3期 365-372页ISTIC
【摘要】 文章回顾了小儿牛黄清心散治疗病毒性呼吸道感染的临床研究,并对小儿牛黄清心散治疗病毒性呼吸道感染活性成分的药理作用及机制进行综述.此外,通过分子对接和分子动力学模拟分析了小儿牛黄清心散治疗病毒性呼吸道感染的关键成分和作用靶点,发现小儿牛黄清心...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Xiangxin Li Yijing Pu 等 《食品科学与人类健康（英文）》 2024年13卷1期 360-369页SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 This study was aimed to analyze the effect of procyanidin B2(PC)and tannin acid(TA)on the activities of cholesterol este...
【关键词】 Cholesterol esterase；Polyphenols；Interaction mechanisms；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 方子超 周隽涵 等 《食品科学》 2024年45卷14期 14-22页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 探索阿魏酸(ferulic acid,FA)羧基取代基团以及丙烯酸碳链长度对苦味抑制作用的影响.本实验使用分子动力学模拟,分析苦味受体与苦味抑制剂FA、4-(2,2,3-三甲基环戊基)丁酸和苦味激活剂安赛蜜相互作用的构象差异,以获得FA对苦...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙熙哲 任乐 等 《中国药物化学杂志》 2024年34卷1期 7-19页ISTICCA
【摘要】 目的 通过多种分子模拟研究方法,探究PARP1受体的结构及其作用方式,为设计PARP1抑制剂提供理论指导.方法 基于PARP1受体的晶体结构,结合分子动力学模拟、动态互相关联矩阵及丙氨酸扫描等方法分析受体-配体作用方式,总结关键氨基酸信息,...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 伊丽 孙茹欣 等 《天然产物研究与开发》 2023年35卷12期 2049-2060页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本研究利用中性蛋白酶对驼血蛋白进行酶解,对其酶解工艺、胰脂肪酶(PDB code:1ETH)抑制活性、多肽分子特征以及分子结合模式进行研究,以期获得高活性的胰脂肪酶抑制肽.结果表明:中性蛋白酶在酶用量为5％、酶解pH为7.0、酶解温度为55...
- 概要：
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