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【中文期刊】 任建芳 罗毅冲  等 《医用生物力学》 2024年39卷1期 46-54页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 探究力对FLNa-Ig21/αⅡbβ3-CT稳定性的影响及调控机制.方法 FLNa-Ig21/αⅡbβ3-CT晶体结构取自PDB数据库.通过平衡和拉伸分子动力学模拟,分析复合物生理环境下稳定性以及力诱导的解折叠路径和力学稳定性.结果 ...

【关键词】 血小板整合素； 分子动力学模拟； 解折叠路径；

【中文期刊】 Haitham Ahmed Al-Madhagi  《数字中医药（英文版）》 2023年6卷1期 67-72页

【摘要】 目的 世界范围内斜蛛属蜘蛛咬伤事故不断增多,急需探索天然抑制剂来抑制最显著的鞘磷脂酶D和透明质酸酶.方法 通过 DrugRep 服务器使用中药抗鞘磷脂酶D(PDB ID:2F9R)和透明质酸酶进行虚拟筛选.通过同一服务器预测吸收、分布、代谢...

【关键词】 斜蛛属蜘蛛； 鞘磷脂酶D； 中医药；

【中文期刊】 汪焰恩 魏庆华  等 《医用生物力学》 2014年29卷2期 99-104页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 从分子微观角度研究复合材料的力学性能及其单组份间发生相互作用的本质.方法 用分子动力学(molecular dynamics,MD)方法模拟研究聚乙烯毗咯烷酮(PVP)、聚乙烯醇(PVA)以及其混合体系PVP/PVA的力学性能、径向分...

【关键词】 聚乙烯毗咯烷酮； 聚乙烯醇； 分子动力学；

【中文期刊】 赵媛 曹泽星  《物理化学学报》 2017年33卷4期 691-708页

【摘要】 酶催化包括底物到活性区的输运、选择催化化学反应及产物释放等复杂过程,由于复杂的蛋白质环境效应,任一化学和非化学过程都有可能是决定酶活性的关键步骤.为了全面认识酶催化活性,我们对几类酶催化过程进行了广泛的组合量子/分子力学(QM/MM)和经典...

【关键词】 酶催化； 底物输运； 自由能计算；

【中文期刊】 任家毅 杨志伟  等 《高等学校化学学报》 2017年38卷11期 2070-2076页

【摘要】 以表皮生长因子Ⅲ型突变体(EGFRvⅢ)抗原多肽与其抗体(MR1)及其人源化突变体的复合物结构为出发点,采用分子动力学中的6种常用力场及3种常用溶剂水模型,分别对上述抗原-抗体复合物进行100 ns的分子动力学模拟与分子力学和连续介质模型计...

【关键词】 单链抗体； 分子动力学模拟； 分子力学和连续介质模型的自由能计算；

【中文期刊】 李涛 刘亚芳  等 《河南大学学报（自然科学版）》 2014年44卷5期 536-541页

【摘要】 蛋白质可以影响晶体的成核及生长速率,从而改变晶体的形貌和习性,因此了解牙釉蛋白在羟基磷灰石(HAP)表面的相互作用对于了解牙齿的生长机理具有重要意义.采用分子动力学(MD)和操控式分子动力学(SMD)相结合的方法研究了六个不同取向的富亮氨酸...

【关键词】 富亮氨酸牙釉蛋白(LRAP)； 羟基磷灰石(HAP)； 吸附；

【中文期刊】 Ting CHEN Fan TONG  等 《浙江大学学报（英文版）（B辑：生物医学和生物技术）》 2020年21卷11期 885-896,中插7-中插11页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 目的:鉴定并阐述6个ACADVL新发突变的对细胞和分子功能的影响,为后期分子诊断和临床病例管理提供科学依据.创新点:本文从分子功能和结构的角度阐述6个新位点对蛋白和细胞功能的不同影响.方法:通过体外构建突变载体建立各突变的过表达细胞系,检测...

【关键词】 线粒体功能障碍； 极长链酰基辅酶A脱氢酶缺乏症； β氧化；

【中文期刊】 朱振泰 孙命  等 《生物化学与生物物理进展》 2007年34卷6期 585-594页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 多肽和蛋白质中Xaa-Pro片段肽脯酰胺键顺反异构对其构象与功能有重要影响.设计合成了一系列模型多肽及其磷酸化多肽,并采用核磁共振实验和分子动力学模拟的方法,研究了所合成多肽中肽脯酰胺键的顺反异构化.结果表明,对脯氨酸之前的Xaa残基进行侧...

【关键词】 肽脯酰胺键； 异构化； 磷酸化；

【中文期刊】 俞伟 宁璐璐  等 《食品与生物技术学报》 2017年36卷10期 1101-1105页

【关键词】 生物大分子； 分子动力学； 计算加速；

【中文期刊】 李雨露 刘小如  等 《食品科学》 2015年36卷17期 83-87页

【关键词】 莲子淀粉； 水分含量； 老化；