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【中文期刊】 康茜 林姿妤 等 《生物技术进展》 2024年14卷6期 1042-1054页
【摘要】 RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)在新型冠状病毒——严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,...
【关键词】 SARS-CoV-2；Omicron；RdRp；
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【中文期刊】 《基因组、蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2007年2卷3期 253-255页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Multiple sequence alignments are successfully applied in many studies for under- standing the structural and functional ...
- 概要：
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【中文期刊】 孔彩华 刘克娜 等 《黑龙江畜牧兽医》 2021年8期 7-11,16,150页
【摘要】 为了解释保山猪和杜洛克猪杂交后代出现毛色分离的原因,寻找判定保山猪纯种与否的分子标记,试验采用PCR扩增、分子克隆与多重序列比对技术,对保山猪MC1R基因编码区序列及杜×保仔猪(S1～S6 窝)MC1R基因型进行分析.结果表明:保山猪MC1...
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【中文期刊】 王占昌 张敏 等 《生物数学学报》 2005年20卷3期 279-285页ISTIC
【摘要】 多序列比对是生物信息学中基础而又重要的序列分析方法.本文提出一种新的多序列比对算法,该算法综合了渐进比对方法和迭代策略,采用加权函数以调整序列的有偏分布,用neighbor-joining方法构建指导树以确定渐进比对的顺序.通过对BAlib...
- 概要：
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【中文期刊】 韦淑亚 赵旭东 等 《浙江农业学报》 2017年29卷2期 345-352页
【摘要】 二穗短柄草(Brachypodium distachyon L.)因与小麦、大麦等有很高的同源性,作为新型禾本科模式生物吸引了越来越多的研究者.试验采用基因克隆技术分离了二穗短柄草BdCDPK4基因的编码区序列,并采用生物信息学方法分析了该...
- 概要：
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【中文期刊】 史定华 周晖杰 等 《上海大学学报(英文版)》 2003年7卷2期 118-123页
【摘要】 In this paper, we report a multiple sequence alignment result on the basis of 10 amino acid sequences of the M protein,w...
【关键词】 SARS (Severe Acute Respiratory Syndrome)；coronavirus；M (Membrane or Matrix) protein；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Guiqi Bi Xinxin Luan 等 《遗传学报》 2024年51卷3期 352-358页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Creating a multi-gene alignment matrix for phylogenetic analysis using organelle genomes involves aligning single-gene d...
【关键词】 Ultrafast alignment；Organelle phylogenomics；Phylogenomic conflict；
- 概要：
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【中文期刊】 林俊杰 郑琳琳 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷4期 719-728页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 多重PCR甲基化靶向测序数据尚缺乏针对性的比对软件.本研究评估了9种比对方案在处理多重PCR甲基化靶向测序数据时的性能,包括平均CPU运行时间、平均最大内存、平均比对率、F1分数、平均比对速率、比对未通过率和差异甲基化位点,以及比对率受亚硫...
【关键词】 DNA甲基化；多重PCR甲基化靶向测序；比对方案；
- 概要：
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【中文期刊】 Gao-Ming Liu Qi Pan 等 《动物学研究》 2023年44卷6期 1064-1079页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 The timing of mammalian diversification in relation to the Cretaceous-Paleogene(KPg)mass extinction continues to be a su...
【关键词】 Mammals；Phylogeny；Diversification；
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【中文期刊】 李满枝 王洪涛 等 《基因组学与应用生物学》 2017年36卷5期 1957-1964页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 多序列比对是生物信息学的一个重要研究内容,比对结果强烈依赖目标函数的参数设置,包括空位罚分以及替换矩阵.基于比对和(SP)目标函数,提出确定各参数最优值的理论依据,给出替换矩阵判断公式和最佳空位罚分取值公式,结合待测序列信息得出与之相符的一...
【关键词】 多序列比对；比对和(SP)目标函数；替换矩阵；
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