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【中文期刊】 陈宇 张绪超 等 《肿瘤防治研究》 2018年45卷1期 1-4页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨"不去重"和"去重"两种方法分析后各NGS相关指标间的差异, 研究"去重"在靶向捕获NGS数据分析中的重要作用.方法 通过对58例肺癌患者的DNA样本进行靶向286基因探针杂交方法建库并进行NGS检测, 每例NGS检测数据分别进行...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄芝准 王红强 《北京生物医学工程》 2017年36卷4期 366-371,419页ISTIC
【摘要】 随着第二代测序技术的发展与应用,其产生的测序数据也呈现快速的增长趋势,如何有效、快速、稳定地对海量测序数据进行分析成为生物研究领域迫切的需求.目前许多传统的测序数据分析软件仅支持单一功能,并不具备完整的数据分析能力,应对海量的测序数据时其处...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘圣 冯祖仁 等 《军事医学》 2014年5期 377-380页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的：对下一代测序数据质量控制的几个主要问题进行分析，设计数据清理和质量控制软件，为下游的数据分析提供保障。方法基于Bioconducter 软件包，开发了一个数据清理软件（ Fastq_clean ）。结果该软件在一组已发表的菊花转录组数...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李剑峰 严天奇 等 《上海交通大学学报（医学版）》 2017年37卷11期 1574-1580页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的·针对基因Panel测序数据整合多种二代测序分析方法,建立一套具备质量控制、基因突变检测的自动化分析及可视化工具.方法·整合FastQC、Prinseq等方法开发针对基因Panel测序数据的质量控制和可视化R包;BWA或TMAP用于FA...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《癌症（英文版）》 2012年31卷10期 463-470页MEDLINEISTICCA
【摘要】 With the development and improvement of new sequencing technology,next-generation sequencing (NGS) has been applied incr...
【关键词】 Next-generation sequencing (NGS)；cancer；personalized treatment；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王文渊 江华 等 《肿瘤代谢与营养电子杂志》 2016年3卷3期 178-183页
【摘要】 目的以人结肠癌RNA 测序数据分析为例，介绍新一代高通量中的RNA-seq 技术在转录组与基因表达谱方面的应用。方法基于Linux 平台的开源分析软件和人结肠癌RNA 测序数据，建立完整的RNA-seq 测序数据处理和分析流程，并对其中的软...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《遗传学报》 2018年45卷7期 345-350页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The application of next-generation sequencing (NGS) technology in cancer is influenced by the quality and purity of tiss...
【关键词】 Patient-derived xenograft；Next-generation sequencing；Host contamination control；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《遗传学报》 2011年38卷11期 505-513页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Over the past decade,there has been a growing realization that studying the small RNA transcriptome is essential for und...
【关键词】 Next-generation sequencing；Small RNA transcriptome；Category；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 姜含芳 刘孝荣 等 《中华微生物学和免疫学杂志》 2019年39卷4期 270-276页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 通过分析百日咳感染患儿的临床信息和鉴定百日咳鲍特菌的基因型、耐药性和亲缘性,了解深圳地区百日咳鲍特菌的流行特点、基因组变异与大环内酯类耐药情况.方法 百日咳患儿的临床信息采集自深圳市儿童医院电子病历系统.我们对分离自患儿咽拭子的31株...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《儿科学（英文）》 2018年2卷2期 72-81页
【摘要】 Next-generation sequencing (NGS) is being used in clinical testing.Government authorities in both China and the United S...
【关键词】 Familial pediatric tumors；Next-generation sequencing；Rare pediatric diseases；
- 概要：
- 方法：
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