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【中文期刊】 刘磊 吴爱东 等 《安徽医科大学学报》 2015年2期 209-213页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:利用Solaris 10操作系统中自带的Perl程序创建具有自适应性质的动态脚本,实现调强放射治疗( IMRT)计划设计的自动执行,并研究其在计划设计中的应用前景。方法选取6例食管癌患者,利用Perl程序创建动态脚本,通过脚本回放,实...
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【中文期刊】 李元 丰磊 等 《生物信息学》 2018年16卷3期 170-177页ISTIC
【摘要】 根据物种学名、分类号、任意一段核酸或蛋白质的序列,判定其属于什么物种及其详细分类的信息如何,是生物信息分析的最为基础且重要的环节,但该过程的分析及结果的获取均为手动,费时费力且容易出错.本研究旨在解决如何在NCBI网站上自动或批量获取物种信...
- 概要:
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【中文期刊】 李旭凯 王钇杰 等 《生物信息学》 2018年16卷3期 178-183页ISTIC
【摘要】 如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战.富集分析为解决这一问题提出了合理的方案.用Perl语言写了一个脚本——Enrich_analysis.pl,可根据基因注释信息进行基因富集...
【关键词】 Enrich_analysis.pl;perl脚本;富集分析;
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【中文期刊】 李旭凯 郭凯 等 《生物信息学》 2013年11卷3期 186-191页ISTIC
【摘要】 用Perl语言编写了一个脚本—ChooseMaterials.pl,通过计算两个材料特定某几列数据之间增加或减少的百分数水平,达到控制变量突出关键因子的作用,方便生物学工作者选取材料,做进一步的实验或分析.
【关键词】 ChooseMaterials.pl;Perl脚本;挑选实验材料;
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【中文期刊】 艾华水 黄路生 《生物信息学》 2006年4卷2期 69-71,91页ISTIC
【摘要】 用Perl语言编写了一个脚本--FS2M01.pl来实现片段大小表向0/1矩阵的转换,解决了由人工方法将遗传图谱的位点信息转换成0/1矩阵的问题.
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【中文期刊】 张程 李程 等 《医学信息》 2025年38卷1期 37-43页
【摘要】 目的 构建与双硫死亡相关长链非编码RNA(DRL)风险评分.方法 从癌症基因组图谱TCGA数据库中下载乳腺癌的转录组数据,使用Perl脚本提取患者的lincRNA数据,通过Sperman相关性分析识别与双硫死亡相关的lincRNA,通过单因...
- 概要:
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【中文期刊】 翟俊斌 曹小利 等 《临床检验杂志》 2024年42卷7期 548-552页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨多黏菌素耐药基因(mobile colistin resistance,mcr)在肺炎克雷伯菌中的流行分布特点.方法 使用Aspera软件从NCBI基因组数据库下载肺炎克雷伯菌的基因组序列,采用CheckM v1.1.3和Ques...
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【中文期刊】 纪静茹 曹小利 等 《临床检验杂志》 2024年42卷4期 298-303页ISTICCA
【摘要】 目的 分析全球皮氏不动杆菌的分布特点、序列分型(ST)及blaOXA基因分布,为感染防控及临床用药提供参考.方法 采用Aspera软件从NCBI批量下载所有皮氏不动杆菌基因组序列(截止日期为2023年11月30日),并使用perl脚本从下载...
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【中文期刊】 罗业浩 唐秀松 等 《西部中医药》 2023年36卷11期 1-7页ISTIC
【摘要】 目的:通过网络药理学方法探讨海桐皮治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的作用机制.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharma-...
- 概要:
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【中文期刊】 唐秀松 陈静 等 《世界中医药》 2022年17卷16期 2245-2250,2257页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:通过构建药物与疾病之间的网络关系探究黄芪对缺血性中风(IS)的治疗机制.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索黄芪有效活性成分和相关靶点;以"Cerebral Ischemic Stroke"为关键词,在人类基因的综...
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