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【中文期刊】 《基因组、蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2005年3卷4期 218-224页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 The three-dimensional (3D) structure prediction of proteins is an important task in bioinformatics. Finding energy funct...

【关键词】 protein structure prediction； fold recognition； contact energy；

【中文期刊】 鄢仁祥 王晓峰  等 《生物信息学》 2015年4期 231-238页 ISTIC

【摘要】 蛋白质折叠识别算法是蛋白质三维结构预测的重要方法之一，该方法在生物科学的许多方面得到卓有成效的应用。在过去的十年中，我们见证了一系列基于不同计算方式的蛋白质折叠识别方法。在这些计算方法中，机器学习和序列谱－序列谱比对是两种在蛋白质折叠中应用...

【关键词】 折叠识别； 序列比对； 结构预测；

【中文期刊】 刘岳 徐海松  等 《生物信息学》 2010年8卷1期 1-6页 ISTIC

【摘要】 蛋白质折叠识别是蛋白质结构研究的重要内容.双绕是α/β蛋白质中结构典型的常见折叠类型.选取22个家族中序列一致性小于25%的79个典型双绕蛋白质作为训练集,以RMSD为指标进行系统聚类,并对各类建立基于结构比对的概形隐马尔科夫模型(prof...

【关键词】 双绕蛋白质； RMSD； 系统聚类；

【会议论文】凌彬 第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会 2014年

【摘要】 Background: Protein structure prediction remains a challenge in the field of computational biology.Traditional protein s...

【关键词】 protein structure prediction； motif； fold recognition；

【外文期刊】 Blundell TL ; Sibanda BL ; 等 《Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B. Biological Sciences》 2006年361卷1467期 413-423页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 structural biology; structural bioinformatics; structure-based drug design;

【外文期刊】 Sauer FG ; Remaut H ; 等 《Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research》 2004年1694卷1/3期 259-267页 SCISCIE

【关键词】 structural basis of fiber formation; pilus assembly; chaperone-usher pathway;

【外文期刊】 Vlahovicek GM ; Cubrilo S ; 等 《Biochimica et biophysica acta: BBA: International journal of biochemistry, biophysics and molecular biololgy. Proteins and Proteomics》 2008年1784卷4期 582-590页 SCISCIE

【关键词】 antibiotic resistance; methylation; modeling;

【外文期刊】 Vishnepolsky,B. ; Managadze,G. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2012年30卷2期 180-190页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Alignment; Contact potentials; Fold recognition;

【外文期刊】 Stewart, AL ; Waters, ML ; 《Chembiochem: A European journal of chemical biology》 2009年10卷3期 539-544页

【关键词】 beta-hairpins; DNA binding; molecular recognition;

【外文期刊】 Alexander Zien ; Ralf Zimmer ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2000年7卷3/4期 483-501页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 protein fold recognition; threading; parameter calibration;