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【中文期刊】 Fatima Zohra Smaili Shuye Tian 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2021年19卷6期 998-1011页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The number of available protein sequences in public databases is increasing exponentially. However, a sig-nificant perce...
【关键词】 Protein function prediction； GO term； EC number；
【中文期刊】 艾亮 冯杰 《生物信息学》 2023年21卷3期 179-186页 ISTIC
【摘要】 本文提出了一种新的快速非比对的蛋白质序列相似性与进化分析方法.在刻画蛋白质序列特征时,首先将氨基酸的10 种理化性质通过主成分分析浓缩为 6 个主成分,并且将每条蛋白质序列里的氨基酸数目作为权重对主成分得分值进行加权平均,然后再融合氨基酸的...
【中文期刊】 《中华医学杂志（英文版）》 2013年126卷18期 3561-3566页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Background Although biomedical ontologies have standardized the representation of gene products across species and datab...
【关键词】 gene ontology； semantic similarity； clustering；
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2009年1期 25-36页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Protein-protein interactions (PPIs) have been widely studied to understand the bi-ological processes or molecular functi...
【关键词】 protein-protein interaction； cancer-associated genes； GO similarity analysis；
【中文期刊】 倪青山 王正志 等 《生物医学工程研究》 2009年28卷2期 87-90页 ISTIC
【摘要】 蛋白质功能预测是后基因组时代研究的重要问题之一.利用蛋白质相互作用网络,提出了一种基于K近邻的蛋白质功能的注释方法,该方法首先计算待注释的蛋白质与所有已知功能的蛋白质间的注释环境相似度,选择其中最相似的K个蛋白质,将该K个蛋白质的功能注释进...
【中文期刊】 梅娟 何胜 等 《食品与生物技术学报》 2010年29卷1期 123-127页
【摘要】 蛋白质的远同源性探测是结构基因组学和功能基因组学的主要研究任务之一.一些具有一定相似结构和功能、但序列相似性却较低的蛋白质组成蛋白质超家族,则远同源性探测问题等价于对蛋白质超家族的识别问题.作者提出了一种基于模块性的聚类算法ModuleFi...
【中文期刊】 王雷生 陶月 等 《中华肝胆外科杂志》 2024年30卷7期 531-536页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:分析序列相似家族3成员C(FAM3C)在胰腺癌中的表达以及对胰腺癌细胞增殖、迁移、侵袭等影响和相关机制。方法:收集2022年7月至2023年6月在江南大学附属医院手术切除的4例胰腺癌患者的癌组织和癌旁组织。聚合酶链反应和Western...
【关键词】 胰腺肿瘤； 甲基转移酶样蛋白3； 序列相似家族3成员C；
【中文期刊】 侯宗文 秦玺 等 《药物分析杂志》 2023年43卷12期 2017-2024页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:分析不同血清型腺相关病毒衣壳蛋白(VP1)氨基酸残基序列,建立相似性比较方法和数据库,预测VP1氨基酸残基序列突变后可能隶属的血清型.方法:对不同血清型腺相关病毒VP1氨基酸残基序列分析,找出共同序列,并对序列进行对齐.分别对疏水氨基...
【关键词】 腺相关病毒； 血清型； 衣壳蛋白氨基酸残基序列；
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