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            【中文期刊】 罗静初  《生物信息学》 2025年23卷3期 165-174页ISTIC

            【摘要】 基于局部序列相似性比对的数据库搜索系统BLAST是生物信息学领域常用工具之一.本文首先介绍数据库相似性搜索的基本概念,包括计分矩阵、空位罚分,以及灵敏度和特异度等;以血红蛋白alpha和beta亚基为例,说明BLAST搜索基本策略,包括分割...

            【关键词】 序列相似性数据库搜索BLAST搜索策略

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            【中文期刊】 刘心雨  姜丹  等 《中国现代中药》 2024年26卷1期 10-17页ISTICCSCDCA

            【摘要】 目的:基于内转录间隔区(ITS)序列,运用DNA条形码技术对滇鸡血藤药材及其混伪品进行序列比对分析,根据单核苷酸多态性位点构建滇鸡血藤单倍型数据库,建立快速、准确鉴定滇鸡血藤的分子鉴定方法.方法:以滇鸡血藤及其混伪品为材料,利用DNA提取试...

            【关键词】 滇鸡血藤内转录间隔区序列DNA条形码

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            【中文期刊】 卢春芸  张能德  等 《广西医学》 2024年46卷12期 1829-1839页ISTICCA

            【摘要】 目的 利用系统动力学方法分析深圳市HIV-1主要流行毒株的有效再生数(Re).方法 从HIV Sequence Database下载2005-2019年深圳市新报告HIV感染者的HIV-1基因序列.对序列进行整理、亚型判定后,利用中国艾滋病...

            【关键词】 人类免疫缺陷病毒1型有效再生数分子簇

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            【中文期刊】 秦浥雯  张嘉仪  等 《生物信息学》 2024年22卷4期 277-286页ISTIC

            【摘要】 纳米抗体是骆驼科动物中发现的抗体的一个亚类,是由单个多肽链组成的多功能分子结合支架.纳米抗体优越的性能决定了其在生物医学、食品科学等领域的广泛应用.尽管纳米抗体序列和结构数据已十分庞大,但其来源的异质性和缺乏标准化阻碍了纳米抗体信息的可靠收...

            【关键词】 纳米抗体数据库序列

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            【中文期刊】 Ningbo Chen  Weiwei Fu  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2020年18卷2期 186-193页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 Next-generation sequencing has yielded a vast amount of cattle genomic data for global characterization of population ge...

            【关键词】 BovineSequence variationSelective signatures

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            【中文期刊】 王金虎  宁琰萍  等 《高原科学研究》 2023年7卷3期 13-21页

            【摘要】 披针叶野决明(Thermopsis lanceolata)具有饲用、有机肥料和药用等多重功效.采用Illumina高通量测序技术,借助K-mer分析工具,揭示了披针叶野决明基因组的多个分子遗传学特征,包括基因组大小、杂合度和GC含量等,此外...

            【关键词】 披针叶野决明高通量测序基因组

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            【中文期刊】 《基因组、蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2005年3卷1期 52-57页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 Copper and iron play important roles in a variety of biological processes, especially when being chelated with proteins....

            【关键词】 copper and irondatabaseprimary sequence analysis

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            【中文期刊】 刘玉智  门剑龙  等 《天津医药》 2018年46卷6期 610-614页MEDLINEISTICCA

            【摘要】 目的 在分子水平探索鼻咽癌的发病机制,筛选鼻咽癌诊断或治疗的潜在分子靶标.方法 在GEO公共数据库中下载编号为GSE12452和GSE13597的基因芯片数据(包含鼻咽癌和对照鼻炎黏膜组织数据),利用R编程语言的相关工具包对原始芯片数据进行...

            【关键词】 鼻咽肿瘤细胞周期寡核苷酸序列分析

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            【中文期刊】 李嘉熙  宋刘梅  等 《中国医学教育技术》 2013年5期 546-548,549页

            【摘要】 近年研究发现pre-miRNA发夹结构两侧的序列对miRNA的成熟至关重要。文章主要介绍了利用“miRBase”和“Ensembl”数据库获得构建microRNA高表达载体的pre-miRNA及其侧翼DNA序列的生物信息学方法:即先通过“m...

            【关键词】 “miRBase”数据库“Ensembl”数据库成熟miRNA

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            【中文期刊】 《亚太热带生物医学杂志(英文版)》 2012年3期 223-227页

            【摘要】 Objective: To establish a polymerase chain reaction (PCR) technique based on cytochrome b (cytb) gene of mitochondria DN...

            【关键词】 Molecular toolBlood meal identificationPolymerase chain reaction

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