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              【中文期刊】 Yiran Shan   Qian Zhang   等 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2022年20卷5期 974-988页SCIMEDLINEISTICCSCDBP

              【摘要】 Sequencing-based spatial transcriptomics(ST)is an emerging technology to study in situ gene expression patterns at the w...

              【关键词】 Spatial transcriptomicsMultimodal information integrationNetwork-based analysis

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              【中文期刊】 Hu-Yao Zhou   Xia Wang   等 《中国神经再生研究(英文版)》 2025年20卷12期 3606-3619页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

              【摘要】 Secondary injury following spinal cord injury is primarily characterized by a complex inflammatory response,with residen...

              【关键词】 acute inflammationbioinformatics analysisfibroblast

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              【中文期刊】 刘改琴   杨琪   等 《中国卫生统计》 2025年42卷6期 843-848,855页ISTICPKUCSCD

              【摘要】 目的 探讨空间主成分分析(spatial principal component analysis,spatial PCA)在卵巢癌(ovarian cancer,OC)空间转录组学数据空间域识别中的应用,识别在基因表达和组织学上空间一致的...

              【关键词】 spatial PCA降维空间转录组空间域识别

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              【中文期刊】 Xinbin Tang   Jiayu Chen   等 《遗传学报》 2023年50卷9期 652-660页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

              【摘要】 Spatial transcriptomics enables the study of localization-indexed gene expression activity in tissues,providing the tran...

              【关键词】 Spatial transcriptomicsIn situ sequencingSingle cell

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              【中文期刊】 葛秦涛   徐文浩   等 《现代泌尿外科杂志》 2025年30卷11期 938-946页ISTICCA

              【摘要】 目的 分析肾透明细胞癌(ccRCC)中癌症相关成纤维细胞(CAF)的异质性谱系,并探讨抗原呈递CAF(apCAF)与三级淋巴结构(TLS)空间分布和形成之间的关系.方法 整合7个ccRCC单细胞测序转录组队列(n=88),运用Harmony...

              【关键词】 透明细胞肾细胞癌三级淋巴结构癌症相关成纤维细胞

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              【中文期刊】 张夏桐   吴文治   等 《口腔医学》 2024年44卷3期 214-220,231页ISTICCA

              【摘要】 单细胞测序和空间转录组技术在生命科学领域的应用是近年的研究热点,通过联合单细胞测序及空间转录组技术,能够在单细胞水平揭示细胞特定空间位置上的信息,以进一步探究疾病发生发展的机制及疾病的防治.在口腔医学领域,这一技术已被应用于口腔组织干细胞、...

              【关键词】 单细胞测序空间转录组口腔医学

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              【中文期刊】 徐子宁   王子仪   等 《皮肤科学通报》 2025年42卷4期 380-386页ISTIC

              【摘要】 疾病演进是动态的生物过程,其分子网络、细胞行为与微环境的协同变化在三维空间和时间维度上呈现高度异质性.近年来,整合成像技术与高通量测序的空间转录组学实现了原位保留组织结构下的全转录组解析.通过多时间点动态采样构建的时空转录组大数据,结合机器...

              【关键词】 空间转录组学时间序列分析疾病进展

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              【中文期刊】 Zhuxia Li   Guangdun Peng   《Biophysics Reports》 2022年8卷3期 119-135页

              【摘要】 Cells and tissues are exquisitely organized in a complex but ordered manner to form organs and bodies so that individual...

              【关键词】 Spatial transcriptomicsSpatial data analysisSpatial multi-omics

              OA
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