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【学位论文】 作者:刘桂瀛 导师:徐本龙 上海师范大学 数学 基础数学(硕士) 2023年
【摘要】 在空间种群模型中,环境的异质性因素往往不可忽略.在这种情况下,相应种群模型的一些参数,将成为空间变量的函数,这将使得物种共存的结果与空间同质中相应结果不同.本文主要研究了两个空间异质环境中的捕食-食饵模型.第一个研究了食饵方程中带有拥挤项的...
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【学位论文】 作者:聂亚婷 导师:王军 上海师范大学 数学 基础数学(硕士) 2022年
【摘要】 近年来,单细胞测序被广泛地应用在细胞异质性的研究,包括细胞类型的鉴定、发现新的细胞类型或细胞状态等。在早期的细胞异质性研究中,由于单细胞测序不够成熟且成本高,所以在仅获取少量的单细胞测序数据下,研究者们利用生物标记法鉴定细胞类型。随着单细胞...
【关键词】 大型单细胞RNA-seq数据 ; 快速聚类 ;
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【学位论文】 作者:朱宜静 导师:王军 上海师范大学 数学 基础数学(硕士) 2022年
【摘要】 肿瘤组织的高度异质性是癌症基因组学研究的一个重要课题.临床实验中获得的肿瘤样本的甲基化谱通常是来自不同成分的混合信号,如癌细胞(cancercells)、正常细胞(normalcells)、基质(stromal)和免疫浸润细胞(Immune...
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【学位论文】 作者:南四威 导师:郑小琪 上海师范大学 数学 基础数学(硕士) 2020年
【摘要】 肿瘤异质性的研究有助于了解肿瘤发生转移的分子机制,对肿瘤患者的诊断和治疗策略的选择具有潜在的指导意义,因此将异质性肿瘤样本反卷积成不同的细胞群是一个十分重要的问题。但在实际的临床实践中,参考信号往往仅有一部分是可用的。解决这一问题的传统方法...
- 概要:
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【学位论文】 作者:赵文娅 导师:王军 上海师范大学 数学 基础数学(硕士) 2020年
【摘要】 在当今精准医疗技术发展的背景下,根据癌症患者自身的基因组学信息和临床表型特征研究癌症患者对治疗的反应至关重要,实现这一目标的关键在于准确预测抗癌药物对病人的敏感性。自大规模药物筛选数据发布以来,人们虽然已经提出了多种抗癌药物敏感性的预测方法...
- 概要:
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【学位论文】 作者:任洁 导师:徐本龙 上海师范大学 数学 基础数学(硕士) 2020年
【摘要】 在本文中,我们研究了两个SIS反应扩散传染病模型.第一个是带有饱和发生率的SIS反应扩散传染病模型.在空间异质环境下,该模型重点讨论了存在性、唯一性和稳定渐近分布.我们给出了该模型下基本再生数Ro的定义及性质.我们的结论表明,如果R0<1时...
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【学位论文】 作者:张硕 导师:徐本龙 上海师范大学 数学 基础数学(硕士) 2020年
【摘要】
本文主要研究了两个三物种竞争模型解的存在性问题.三物种竞争系统是一类重要的生物竞争系统,是目前生物系统竞争理论研究的一个前沿方向.与单个物种或两个物种竞争的模型相比,三物种竞争模型具有更复杂的结构,可以更好的描述诸多生物现象.
第...
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【学位论文】 作者:魏娜娜 导师:郑小琪 上海师范大学 数学 基础数学(硕士) 2020年
【摘要】 本文主要研究两组肿瘤样本的差异甲基化位点检测问题。DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,在细胞过程(包括基因调节,发育和疾病)中具有重要作用,并且在大多数类型的癌症中广泛出现调节异常。推断具有不同基因型或表型的两组肿瘤样本之间的差异甲基化C...
- 概要:
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【学位论文】 作者:安彪 导师:郑小琪 上海师范大学 数学 基础数学(硕士) 2018年
【摘要】 由于遗传因素,环境因素和疾病的多样性,癌症病人会对每种癌症的治疗方案做出不同的反应。利用基因信息预测药物敏感性是个体化医疗中极为重要的一项任务,已经受到包括机器学习,数据挖掘和计算生物学等多个领域的关注。通过预测药物敏感性,肿瘤学家可以对每...
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