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【学位论文】 作者：李明导师：牛登科 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2012年
【摘要】 随着新一代测序技术的高速发展,越来越多的物种全基因组数据被测定完成,并且形成了更易获取的相关数据库。不同物种基因组大小间的差异及其意义再次引起了更多的关注。作为遗传信息的载体,基因组大小显然关系到信息的承载量和调控能力,但同时又不能忽视其与...
- 概要：
- 方法：
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【学位论文】 作者：李臻导师：林魁 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2011年
【摘要】 被子植物是地球陆地生态系统的优势类群,它们的产生以及快速的分化依旧令人不解。早先的研究表明,相比于其它真核生物,全基因组复制在被子植物的进化过程中多次发生,并且可能帮助被子植物的祖先度过了白垩纪.第三季间期的物种大灭绝时期,并促进了随后的适...
- 概要：
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- 结论：
【学位论文】 作者：都洪胜导师：牛登科 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2011年
【摘要】 真核生物基因组中内含子的长度在基因组内和物种间的差异都比较大,它的进化机制现在还不是很清楚。有研究表明,表达量高的基因具有较短的内含子、表达量较低的基因具有较长的内含子。转录效率假说认为这是为了帮助基因节约转录过程中所需要的能量或时间。而C...
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【学位论文】 作者：闫鹏程导师：林魁 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2011年
【摘要】 结合新一代测序技术,进化实验可以方便的研究基因组变异与微生物进化之间以及与特定环境之间的关系。本研究在缺氮条件下和正常条件下分别对大肠杆菌种群进行了200天,约1300代的长期培养并利用高通量测序技术对进化实验中的11个进化种群和2个祖先种...
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【学位论文】 作者：曹建立导师：牛登科 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2011年
【摘要】 线粒体DNA核内插入序列(numt)是指在线粒体中观察到的与细胞核DNA具有相似性的片段。这些片段可以通过多种机制插入到染色体中；但是,人们对numt的插入机制的了解还不够全面。现在的研究主要集中在numt如何从线粒体转移出来以及如何插入到...
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【学位论文】 作者：李伟导师：林魁 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2011年
【摘要】 微生物群落拥有丰富的物种多样性,每个物种都有自己的一套基因、细胞组成和代谢反应,并不断与周围环境发生着复杂的相互作用。传统的研究方法已不能告诉我们群落中发生了什么代谢反应,同时高通量测序技术的快速发展促进了群落基因组学(宏基因组学)这一新兴...
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- 结论：
【学位论文】 作者：吴杨导师：林魁 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2010年
【摘要】 随着新一代测序技术的发展，越来越多的基因组正在或将要被测序，使得搭建良好的基因组注释平台变得日益重要。随着基因组学相关研究的深入，RNA基因、重复序列等元件的注释已成为真核基因组注释流程中的重要组成部分。重复序列中的转座元件在基因组进化中扮...
- 概要：
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- 结论：
【学位论文】 作者：郭文萍导师：牛登科 北京师范大学 生物学 生物信息学（硕士） 2010年
【摘要】 在多细胞动物的全基因组范围上,外显子一内含子边界上氨基酸使用偏好是一个非常普遍的现象。一般认为,这是由于外显子边界上存在有助于剪接的保守信号序列。前人研究发现,有些内含子剪切时以外显子为剪接识别单位,称为外显子定义。这些内含子的剪切过程对外...
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