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【学位论文】 作者:王健 导师:陈永川 南开大学 数学 数学;应用数学(博士) 2016年
【摘要】 蛋白质是生物学和计算生物学领域最基本最重要的研究对象之一。蛋白质关联图是蛋白质三维空间结构简洁高效的二维表示,它与组合数学中的集合划分、匹配等经典组合结构密切相关。本文从蛋白质关联图的两种基本结构:堆(stack)和队列(queue)入手,...
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【学位论文】 作者:靳宇 导师:Christian M.Reidys 南开大学 数学 数学;应用数学(博士) 2010年
【摘要】 本文主要是对RNA序列结构进行组合分析,从而进一步优化现有预测RNA结构的算法。我们提出了对RNA带扭结结构的新的分类方法,更有效的推广归纳了二级结构,即我们将结构表示成简图,根据最多彼此相交的碱基对k-1来划分带扭结的结构。k=2时就是R...
- 概要:
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【学位论文】 作者:秦晶 导师:Christian Reidys 南开大学 数学 数学;应用数学(博士) 2010年
【摘要】 本文主要涉及核糖核酸(RNA)本身三级结构和核糖核酸之间相互作用结构的一些组合学和计算生物学的相关结果。假设k为正整数,k不相交tangle图这一组合概念起源于计算生物学对核糖核酸三级结构的研究。众所周知,在[14]中,陈永川教授等建立了集...
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【学位论文】 作者:马刚 导师:Christian M.Reidys 南开大学 数学 数学;应用数学(博士) 2010年
【摘要】 RNA在蛋白质合成中发挥着非常重要的作用。RNA包含转移RNA(tRNA),信使RNA(mRNA)和核糖体RNA(rRNA)。转移RNA起着携带和转移活化氨基酸的作用;信使RNA是合成蛋白质的模板:核糖体RNA是细胞合成蛋白质的主要场所。R...
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